83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3365 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 299 aa  594  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305882  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.33 
 
 		 300 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.62 
 
 		 302 aa  326  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.49 
 
 		 300 aa  301  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.36 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.94019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.33 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0225726  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1459  hypothetical protein  30.92 
 
 		 329 aa  119  9e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.487858  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0056  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262726  decreased coverage  0.00262088 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 		 340 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4808  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  32.11 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.892745  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.9 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.99 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 		 329 aa  52.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.284627  normal  0.304457 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.2 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.71 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 		 355 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  24.35 
 
 		 336 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  26.39 
 
 		 329 aa  48.9  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  23.99 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  23.86 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.31 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0024  UDP-glucose 4-epimerase  29.12 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  27.97 
 
 		 363 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  39.73 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 		 329 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  24.54 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.45 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  30.56 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  24.45 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  24.45 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 		 431 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.45 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.73 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.094979  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  29.52 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.45 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.45 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  29.41 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  32.17 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0274  dihydroflavonol 4-reductase family protein  24.06 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.522156 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  23.81 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  25.36 
 
 		 251 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0893  UDP-glucose 4-epimerase  33.11 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0932116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  26.96 
 
 		 336 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  27.24 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1259  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.38 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  24.46 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  24.46 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03949  NAD(P)H steroid dehydrogenase  34.23 
 
 		 336 aa  43.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.55 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  24.46 
 
 		 335 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18870  UDP-galactose 4-epimerase  31.45 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3016  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.72 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3248  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.72 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  26 
 
 		 304 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  31.21 
 
 		 321 aa  42.7  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  54.55 
 
 		 402 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 		 201 aa  42.4  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>