150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1553 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
300 aa  604  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.33 
 
 
299 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305882  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.45 
 
 
302 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.15 
 
 
300 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.67 
 
 
300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.94019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.01 
 
 
302 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.47 
 
 
328 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0225726  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1459  hypothetical protein  32.81 
 
 
329 aa  122  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.487858  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
361 aa  72.4  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
328 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0056  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262726  decreased coverage  0.00262088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4808  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  32.13 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.892745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.54 
 
 
333 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  25.69 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.57 
 
 
338 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  25.69 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.9 
 
 
306 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
349 aa  60.1  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  26.64 
 
 
335 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  25 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  25 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
339 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  27.84 
 
 
338 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  25.63 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  25.99 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  25.99 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.63 
 
 
335 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.63 
 
 
335 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  25.99 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.91 
 
 
358 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.64 
 
 
298 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  27.31 
 
 
363 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
347 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  25.87 
 
 
340 aa  53.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
306 aa  53.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.94 
 
 
318 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
355 aa  53.1  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 
429 aa  52.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 
331 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.19 
 
 
296 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.48 
 
 
330 aa  52.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.18 
 
 
329 aa  52.8  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
340 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 
328 aa  52.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 
328 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  24.14 
 
 
342 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.95 
 
 
478 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 
340 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  24.71 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 
431 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
329 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
329 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
329 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  23.75 
 
 
340 aa  49.7  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3016  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.97 
 
 
328 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3248  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.97 
 
 
328 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
450 aa  49.3  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 
301 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.99 
 
 
305 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  25.55 
 
 
336 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  23.75 
 
 
328 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.54 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  27.8 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  23.13 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3247  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.66 
 
 
328 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  23.13 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 
331 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
489 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3001  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.66 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2938  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.66 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.793849  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  25.29 
 
 
329 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.284627  normal  0.304457 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.24 
 
 
331 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  29.17 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07140  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.81 
 
 
329 aa  47.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184907  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
354 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0848085  normal  0.577467 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
320 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  27.13 
 
 
329 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  27.13 
 
 
329 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
328 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11357  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  37.33 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  32.03 
 
 
340 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 
286 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.77 
 
 
294 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1958  dihydroflavonol-4-reductase family protein  26.98 
 
 
335 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169655  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
351 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
351 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
309 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>