79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4808 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4808  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  100 
 
 		 298 aa  570  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.892745  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1459  hypothetical protein  36.28 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.487858  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 		 328 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0225726  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0056  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.53 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262726  decreased coverage  0.00262088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.74 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.2 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.94019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.97 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305882  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  32.46 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.38 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  58.7 
 
 		 341 aa  49.7  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.43 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.3 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4203  hypothetical protein  37.14 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0195164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0420481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.31 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.53 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 		 339 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3852  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.19 
 
 		 430 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332822  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 		 324 aa  45.8  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  32.54 
 
 		 252 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44260  NAD dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.86 
 
 		 506 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  31.71 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  36.05 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.51 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.39 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7867  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 		 207 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  30.82 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.24 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5517  hypothetical protein  55 
 
 		 203 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.56 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  34.74 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  31.07 
 
 		 212 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 		 383 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2209  hypothetical protein  23.08 
 
 		 514 aa  43.1  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1783  hypothetical protein  52.94 
 
 		 208 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0359624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  25.95 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  25.71 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0458  hypothetical protein  52.94 
 
 		 208 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 		 313 aa  43.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.72 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 		 412 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  34.52 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3362  domain of unknown function DUF1731  36.08 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  34.52 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  34.52 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  34.52 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  34.52 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 		 341 aa  42.7  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 		 325 aa  42.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  28.48 
 
 		 246 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  35.8 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  29.63 
 
 		 216 aa  42.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.94 
 
 		 203 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1770  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 		 342 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.759605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 		 320 aa  42.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>