79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3654 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 300 aa  597  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.94019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.67 
 
 		 300 aa  326  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.86 
 
 		 302 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.33 
 
 		 300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.48 
 
 		 299 aa  293  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305882  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.84 
 
 		 302 aa  258  9e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.48 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0225726  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1459  hypothetical protein  37.55 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.487858  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0056  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262726  decreased coverage  0.00262088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4808  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  32.41 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.892745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  26.36 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.8 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.3 
 
 		 341 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0829  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000444894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 		 333 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  33.83 
 
 		 340 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0777  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2336  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.74 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  26.07 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  21.56 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  21.56 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 329 aa  50.1  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 		 392 aa  49.7  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  23.11 
 
 		 329 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 		 340 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.83 
 
 		 338 aa  49.7  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.49 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  30.34 
 
 		 512 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2290  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.82 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5276  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.48 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 		 361 aa  46.6  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0632  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.93 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.75 
 
 		 292 aa  46.2  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.51 
 
 		 355 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.19 
 
 		 327 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 		 295 aa  45.8  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61280  putative epimerase  27.1 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.33 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.21 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3337  hypothetical protein  25.81 
 
 		 491 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.246336  normal  0.84548 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  32.77 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.53 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  31.93 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.92 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.04 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 		 439 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.06 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 		 349 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 		 291 aa  43.1  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 329 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0274  dihydroflavonol 4-reductase family protein  25 
 
 		 354 aa  42.7  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.522156 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.99 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 346 aa  42.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 332 aa  42.7  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0240  dihydroflavonol 4-reductase family protein  24.7 
 
 		 329 aa  42.7  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00224634  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4932  putative oxidoreductase  26.45 
 
 		 329 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.43 
 
 		 342 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1030  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.75 
 
 		 476 aa  42.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  28.81 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>