95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3769 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 300 aa  600  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.32 
 
 		 302 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.15 
 
 		 300 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.49 
 
 		 299 aa  301  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305882  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.17 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.94019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.19 
 
 		 302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0225726  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1459  hypothetical protein  33.19 
 
 		 329 aa  109  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.487858  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0056  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262726  decreased coverage  0.00262088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4808  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  33.74 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.892745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 		 347 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 		 450 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 		 424 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0560564  normal  0.509097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.49 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.04 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.54 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.51 
 
 		 392 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 		 323 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  21.09 
 
 		 338 aa  53.1  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.24 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.01 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0240  dihydroflavonol 4-reductase family protein  28.57 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00224634  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 		 329 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0829  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000444894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.74 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.284627  normal  0.304457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0274  dihydroflavonol 4-reductase family protein  27.46 
 
 		 354 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.522156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2336  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.92 
 
 		 357 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 		 412 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.7 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.17 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.92 
 
 		 361 aa  46.6  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 322 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  31.96 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  26.79 
 
 		 363 aa  46.2  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 		 336 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  21.77 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.03 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.84 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.793849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0632  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.5 
 
 		 340 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.75 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0024  UDP-glucose 4-epimerase  26.48 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  21.35 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  25 
 
 		 137 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1836  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 		 346 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 		 346 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0412358  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000061436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  25.3 
 
 		 323 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  32.95 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.76 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.61 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0777  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 		 337 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  26.32 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  24.21 
 
 		 329 aa  42.7  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.21 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  25.36 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.26 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  35.62 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  35.62 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  35.62 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  40 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3375  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.11 
 
 		 329 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.9 
 
 		 297 aa  42.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  35.62 
 
 		 297 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  29.9 
 
 		 297 aa  42.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 		 337 aa  42.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 		 310 aa  42.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 		 298 aa  42.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1819  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 		 343 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000110086  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  24.47 
 
 		 340 aa  42.4  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>