More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2426 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
332 aa  681    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.341726  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
306 aa  93.2  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
308 aa  86.7  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  26.52 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
335 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.64 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.74 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
336 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0618  oligopeptide transporter OPT  28.74 
 
 
335 aa  77  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.681243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3000  NDP-sugar dehydratase or epimerase  21.99 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.82127  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  26.2 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2241  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  26.19 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2598  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
358 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.91 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  27.52 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  23.6 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.56 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0592  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1400  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  28.06 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  26.88 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4115  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.39 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  28.11 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.29 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.31 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.61 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5621  nucleotide sugar epimerase  26.8 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259916  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  25.45 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1182  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  25.88 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  27.27 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
315 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
317 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0038  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
335 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  23.15 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2640  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11260  putative epimerase  25.71 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3735  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.607722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26.38 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  23.53 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>