More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0124 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0124  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1355  DNA-binding response regulator  93.78 
 
 		 225 aa  431  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0300  DNA-binding response regulator  92.44 
 
 		 225 aa  429  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0232  DNA-binding response regulator  42.6 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.156156  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0286  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_94  DNA-binding response regulator  38.67 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0170  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0274  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0106  two component transcriptional regulator  41.06 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_106  DNA-binding response regulator  37.67 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1540  DNA-binding response regulator  38.01 
 
 		 225 aa  161  9e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1311  DNA-binding response regulator  34.39 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1330  DNA-binding response regulator  42.31 
 
 		 209 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1432  DNA-binding response regulator  37.56 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1394  DNA-binding response regulator  37.1 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_86  DNA-binding response regulator  39.01 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0316  DNA-binding response regulator  36.65 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1322  DNA-binding response regulator  33.94 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.423029  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0304  response regulator  35 
 
 		 223 aa  147  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0177  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_166  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_85  DNA-binding response regulator  34.84 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0176  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  32.75 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  138  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.75 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  32.3 
 
 		 232 aa  138  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  32.3 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1261  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 236 aa  134  9e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1071  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.16 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  31.56 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1573  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  33.77 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2572  two component transcriptional regulator  32.47 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.88 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2970  two component transcriptional regulator  31 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.068725 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3275  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.31 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000116561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  32.75 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  32.31 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  32.31 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  32.31 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  32.31 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2386  two component transcriptional regulator  32.48 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.3038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.76 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  32.31 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  32.31 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  32.31 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05730  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.3 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.587783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  35.53 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  31.56 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3195  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.88 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  34.07 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.67 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.06 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.96 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  31.42 
 
 		 233 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  31.3 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  34.06 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0458  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.16 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4400  DNA-binding response regulator  33.77 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4417  DNA-binding response regulator  33.77 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  33.77 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.84 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3372  winged helix family two component transcriptional regulator  32.05 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690812  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4565  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4781  DNA-binding response regulator  33.77 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  32.89 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.22 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.06 
 
 		 234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2490  DNA-binding response regulator KdeP  34.5 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  32.46 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  34.82 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0057  two component transcriptional regulator  34.5 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.08 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0059  response regulator receiver  34.5 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  28.51 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  31.28 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3504  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.59 
 
 		 248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001205  DNA-binding response regulator  32.61 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>