More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0300 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0300  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1355  DNA-binding response regulator  93.33 
 
 		 225 aa  430  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0124  two component transcriptional regulator  92.44 
 
 		 225 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0232  DNA-binding response regulator  42.15 
 
 		 227 aa  191  9e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.156156  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0286  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_94  DNA-binding response regulator  39.01 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0170  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0274  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_106  DNA-binding response regulator  37.95 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0106  two component transcriptional regulator  41.83 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1540  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1311  DNA-binding response regulator  34.39 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1432  DNA-binding response regulator  37.39 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1330  DNA-binding response regulator  41.43 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0177  DNA-binding response regulator  34.38 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_86  DNA-binding response regulator  35.27 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1322  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.423029  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_166  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0304  response regulator  35 
 
 		 223 aa  147  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1394  DNA-binding response regulator  34.84 
 
 		 225 aa  148  9e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0176  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0316  DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_85  DNA-binding response regulator  34.82 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1071  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  34.22 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3275  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 232 aa  138  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000116561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1261  DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.75 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  31.11 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  31.88 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  31.56 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.88 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  32.63 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1573  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  32.89 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.62 
 
 		 235 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.06 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3195  two component transcriptional regulator, winged helix family  31 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  30.67 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  31.86 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  30.22 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  30.67 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  30.22 
 
 		 232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  30.8 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  31.25 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  30.8 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  31.88 
 
 		 234 aa  128  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  32.17 
 
 		 232 aa  128  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 223 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 223 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  30.8 
 
 		 223 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.42 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  30.77 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  31.44 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  30.22 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  31.44 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  31.44 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  30.22 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  31.44 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  31.44 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  30.22 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2970  two component transcriptional regulator  29.82 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.068725 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  31.44 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  31.44 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0185  DNA-binding response regulator CreB  30.77 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.68 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  37.37 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.06 
 
 		 246 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.44 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2725  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0716975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2572  two component transcriptional regulator  32.03 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.08 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.08 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  30.36 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  30.7 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.53 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  30.36 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  30.7 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.12 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0715  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.44 
 
 		 224 aa  125  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 1629 aa  124  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 251 aa  124  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>