More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3028 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3028  ABC transporter related  100 
 
 		 278 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0925872  normal  0.887889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  46.88 
 
 		 264 aa  232  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  46.09 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  46.77 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  45 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.61 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  48.61 
 
 		 270 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  45.63 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  44.02 
 
 		 259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 256 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  44.53 
 
 		 270 aa  218  7e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  43.92 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  47.98 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  43.53 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  44.23 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  45.56 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  44.49 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  43.31 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  43.58 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  43.92 
 
 		 259 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  45.24 
 
 		 257 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  46.59 
 
 		 261 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  44.84 
 
 		 257 aa  211  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  43.75 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  44.92 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  46.15 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  42.58 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  43.38 
 
 		 275 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  44.72 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  43.38 
 
 		 275 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  43.8 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  43.77 
 
 		 276 aa  206  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2499  ABC transporter related  49.03 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.513432  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  44.44 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  46.3 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  42.75 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  43.25 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  43.97 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  43.35 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  44.71 
 
 		 264 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  42.58 
 
 		 255 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  47.56 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  42.41 
 
 		 265 aa  206  5e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  42.46 
 
 		 268 aa  206  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  43.65 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  42.47 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 271 aa  205  8e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  44.84 
 
 		 258 aa  204  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  44.44 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  41.41 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  43.65 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.94 
 
 		 256 aa  204  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.94 
 
 		 258 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  45.93 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  41.73 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  42.05 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  42.34 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  41.41 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  44.22 
 
 		 271 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.05 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  42.86 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  41.7 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  41.7 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  41.7 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  41.9 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  44.72 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  43.65 
 
 		 256 aa  199  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  41.13 
 
 		 258 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0536  ABC transporter related  40.16 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.508685  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  42.08 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  42.08 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  44.14 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0097  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.32 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.232532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  41.02 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0334  ABC transporter related  47.67 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  41.02 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  43.08 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  42.91 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  41.38 
 
 		 261 aa  196  5.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0565  ABC transporter related  41.67 
 
 		 255 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0274891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  38.1 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  42.35 
 
 		 260 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4944  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.2 
 
 		 257 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  38.52 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2110  ABC transporter related  44.66 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.71 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.71 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  39.78 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0654  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.2 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.6 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  40.87 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>