More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3215 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3215  integrase, catalytic region  100 
 
 		 212 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2172  integrase catalytic region  91.62 
 
 		 300 aa  362  3e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3175  integrase catalytic region  91.62 
 
 		 300 aa  360  6e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0277511  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0848  transposase  42.78 
 
 		 289 aa  153  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.556417  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0112  transposase  44 
 
 		 289 aa  150  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0546  transposase  44 
 
 		 289 aa  150  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0841  transposase  44 
 
 		 289 aa  150  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1194  integrase catalytic region  41.18 
 
 		 293 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0470498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  34.1 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  34.68 
 
 		 291 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  30.36 
 
 		 281 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  32.94 
 
 		 390 aa  95.9  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  32.94 
 
 		 393 aa  95.9  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  32.94 
 
 		 390 aa  95.9  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  32.94 
 
 		 390 aa  95.9  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  30.68 
 
 		 281 aa  95.1  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  31.66 
 
 		 385 aa  92.8  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2887  Integrase catalytic region  32.18 
 
 		 271 aa  92.8  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1393  Integrase catalytic region  32.18 
 
 		 271 aa  92.8  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0470  transposase  30.89 
 
 		 269 aa  92.4  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0441  integrase catalytic subunit  30.9 
 
 		 254 aa  92  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  35.44 
 
 		 278 aa  91.7  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  32.65 
 
 		 278 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  32.65 
 
 		 278 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0639  IS5 family transposase orfB  32.93 
 
 		 273 aa  90.9  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  28.65 
 
 		 286 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4217  Integrase catalytic region  30.16 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0771  Integrase catalytic region  30.16 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  32.82 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2546  Integrase catalytic region  30.16 
 
 		 274 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2533  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  37.4 
 
 		 239 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3041  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  37.4 
 
 		 239 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  25.67 
 
 		 291 aa  88.6  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2164  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  37.4 
 
 		 239 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2250  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  37.4 
 
 		 239 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  31.31 
 
 		 512 aa  87.8  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  32.14 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1456  integrase catalytic region  27.49 
 
 		 237 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0392097 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1593  transposase  29.03 
 
 		 156 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129396  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  28.65 
 
 		 319 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0876  Integrase catalytic region  26.98 
 
 		 286 aa  86.3  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1339  integrase catalytic subunit  31.69 
 
 		 283 aa  85.5  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  39.53 
 
 		 283 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  27.81 
 
 		 278 aa  85.1  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 268 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 268 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 268 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1070  integrase catalytic subunit  31.15 
 
 		 283 aa  85.1  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00450828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 268 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0354  transposase  32.34 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.163187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  28.9 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  38.06 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  38.06 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  38.06 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  38.06 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  38.06 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  29.51 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3446  transposase  33.33 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000031866 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5220  transposase  32.34 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041055  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  39.53 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0553  transposase  32.93 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000171843  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  39.53 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  39.53 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  39.53 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  39.53 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5175  transposase  32.93 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2805  integrase core domain protein  32.34 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  24.73 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3205  transposase  32.93 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  39.53 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00510  ISxac3 transposase  28.03 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653453  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  24.73 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  39.53 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  39.53 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  24.73 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0737  transposase  32.93 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120329  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  30.1 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1784  transposase  32.93 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1689  transposase  32.93 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1980  integrase catalytic subunit  30.1 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.340546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4045  transposase  32.93 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1214  integrase core domain protein  32.34 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000600847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  39.53 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  39.53 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  39.53 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  24.73 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  24.73 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  33.77 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  25.81 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  33.77 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  33.77 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5539  transposase  27.62 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.0199842 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  29.9 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  28.26 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  27.42 
 
 		 293 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  27.42 
 
 		 293 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  33.93 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  27.42 
 
 		 293 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  27.39 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  26.9 
 
 		 286 aa  81.6  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>