More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2172 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2172  integrase catalytic region  100 
 
 		 300 aa  626  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3175  integrase catalytic region  99 
 
 		 300 aa  620  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0277511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3215  integrase, catalytic region  91.62 
 
 		 212 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0546  transposase  44.03 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0112  transposase  44.03 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0841  transposase  44.03 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0848  transposase  43.28 
 
 		 289 aa  228  9e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.556417  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3214  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1194  integrase catalytic region  39.1 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0470498  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  36.98 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  36.98 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  36.98 
 
 		 269 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  40.72 
 
 		 283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  40.72 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  40.72 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  40.72 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  40.72 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  40.72 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  40.72 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  40.72 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  40.72 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  40.72 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  40.72 
 
 		 283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  40.72 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  36.6 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  38.02 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  38.02 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  38.02 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  38.02 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2250  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  37.72 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2164  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  37.72 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3041  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  37.72 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2533  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  37.72 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  36.33 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  36.33 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  33.57 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  39.01 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  39.01 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  39.01 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  39.01 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  39.01 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  35.97 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  35.97 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  33.93 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  33.46 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  33.46 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  30.91 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0647864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  34.6 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  34.6 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  35.93 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  34.6 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  34.6 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  37.56 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  38.16 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  32.71 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  32.71 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  32.71 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  36.32 
 
 		 248 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  36.32 
 
 		 248 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  36.32 
 
 		 248 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  36.32 
 
 		 248 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  36.32 
 
 		 248 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  36.32 
 
 		 248 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  36.32 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  36.32 
 
 		 248 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  33.21 
 
 		 270 aa  146  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  33.21 
 
 		 270 aa  146  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  34.07 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  34.07 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  34.2 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1365  transposase  39.7 
 
 		 246 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0447e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2862  transposase  39.7 
 
 		 246 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1214  integrase core domain protein  34.32 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000600847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2805  integrase core domain protein  34.32 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153033 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0509  transposase  39.2 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0347  integrase core domain protein  39.2 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1099  transposase  39.2 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.41959e-57 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0515  transposase  39.2 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1312  transposase  39.2 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2024  transposase  39.2 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.08352e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2994  transposase  39.2 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4078  transposase  39.2 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0741694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5220  transposase  33.95 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  34.2 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  34.2 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0354  transposase  33.95 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.163187  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  34.2 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  34.2 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1522  transposase  39.2 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.60985e-43 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  34.2 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3446  transposase  34.43 
 
 		 284 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000031866 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  37.44 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>