More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3214 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3175  integrase catalytic region  100 
 
 		 300 aa  211  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0277511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2172  integrase catalytic region  100 
 
 		 300 aa  211  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3214  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  207  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0848  transposase  44.93 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.556417  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0841  transposase  44.93 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0112  transposase  44.93 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0546  transposase  44.93 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  43.08 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  43.08 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  43.08 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  43.08 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  43.08 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  43.08 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  43.08 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  43.08 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  43.08 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  42.65 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  42.65 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  42.65 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  42.65 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  42.65 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  43.08 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  43.08 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  43.08 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  43.08 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  43.08 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  43.08 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  43.08 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  41.18 
 
 		 278 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1099  transposase  45.31 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.41959e-57 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  38.24 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  38.24 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  38.24 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  38.24 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  38.24 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0515  transposase  45.31 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1312  transposase  45.31 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2024  transposase  45.31 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.08352e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2862  transposase  45.31 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2994  transposase  45.31 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4078  transposase  45.31 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0741694  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  39.71 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  39.71 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0347  integrase core domain protein  45.31 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  36.92 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  36.92 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1365  transposase  45.31 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0447e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1522  transposase  45.31 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.60985e-43 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0509  transposase  45.31 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  39.39 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  39.39 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  39.39 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  39.39 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  39.13 
 
 		 279 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  39.13 
 
 		 279 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 		 268 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 		 268 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4363  transposase  35.21 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267789  hitchhiker  2.99756e-22 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  39.13 
 
 		 279 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  35.21 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  35.21 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  35.21 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  39.13 
 
 		 279 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  38.46 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  38.46 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  38.46 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  38.46 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  38.46 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  38.46 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  38.46 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  38.46 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  41.67 
 
 		 278 aa  57.4  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 270 aa  57  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 270 aa  57  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  45.16 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  36.76 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  36.76 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  36.76 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  38.89 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  38.89 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  34.78 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  34.78 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2164  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  39.68 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2533  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  39.68 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2250  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  39.68 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3041  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  39.68 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  34.92 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  34.92 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  34.78 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  34.78 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1417  IS861, transposase (orf2), IS3 family, truncated  39.44 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15050  transposase  39.13 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.316809  normal  0.91579 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  34.92 
 
 		 289 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  34.92 
 
 		 289 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  34.92 
 
 		 289 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  33.85 
 
 		 278 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  40.91 
 
 		 272 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1278  ISSd1, transposase orfB  40.91 
 
 		 272 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1599  ISSd1, transposase orfB  40.91 
 
 		 272 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000676814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>