More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1417 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1417  IS861, transposase (orf2), IS3 family, truncated  100 
 
 		 212 aa  441  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  79.62 
 
 		 278 aa  356  1.9999999999999998e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  75.83 
 
 		 277 aa  338  2.9999999999999998e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  75.83 
 
 		 277 aa  338  2.9999999999999998e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0101  transposase  80.62 
 
 		 162 aa  278  4e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0018  transposase  80.62 
 
 		 162 aa  277  9e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0291  transposase  77.5 
 
 		 162 aa  262  3e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0515999  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1760  transposase  77.48 
 
 		 152 aa  247  7e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  56.6 
 
 		 279 aa  224  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  56.6 
 
 		 279 aa  224  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  56.6 
 
 		 279 aa  224  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  56.6 
 
 		 279 aa  224  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  54.03 
 
 		 270 aa  221  9e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  54.03 
 
 		 270 aa  221  9e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  52.34 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  52.34 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  52.34 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  52.34 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  52.34 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  52.34 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  52.34 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  52.34 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  52.34 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  52.34 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  52.34 
 
 		 283 aa  218  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  51.87 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  53.3 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  53.3 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  53.3 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  53.81 
 
 		 278 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  53.81 
 
 		 278 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  52.61 
 
 		 268 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4363  transposase  53.3 
 
 		 215 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267789  hitchhiker  2.99756e-22 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  52.13 
 
 		 268 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  52.13 
 
 		 259 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  52.13 
 
 		 259 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  52.13 
 
 		 259 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  52.13 
 
 		 259 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  52.13 
 
 		 259 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  53.3 
 
 		 270 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  53.3 
 
 		 270 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  53.3 
 
 		 270 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  52.83 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  51.66 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  51.66 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  51.17 
 
 		 252 aa  208  5e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  51.17 
 
 		 252 aa  208  5e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  51.17 
 
 		 252 aa  208  5e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  51.17 
 
 		 252 aa  208  5e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  50.94 
 
 		 278 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  50.94 
 
 		 278 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  50.94 
 
 		 278 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  50.94 
 
 		 278 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1165  integrase catalytic region  50.94 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  50.24 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  50.24 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  50.24 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  50.24 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  50.24 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  50.24 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  50.24 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  50.24 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1459  IS3 family transposase  52.11 
 
 		 261 aa  204  5e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000914872  normal  0.0630219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1788  IS3 family transposase  52.11 
 
 		 261 aa  205  5e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0006  IS3 family transposase  52.11 
 
 		 261 aa  204  6e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149374 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0717  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 		 261 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.558663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0848  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 		 261 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1577  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 		 261 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2077  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 		 261 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.74373  normal  0.201044 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2412  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 		 261 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.714231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2437  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 		 261 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  51.67 
 
 		 278 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  48.11 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  48.11 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  48.11 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  51.18 
 
 		 278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  51.18 
 
 		 278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  51.18 
 
 		 278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  51.18 
 
 		 278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  51.18 
 
 		 278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  49.76 
 
 		 249 aa  194  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  49.76 
 
 		 267 aa  194  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  49.76 
 
 		 267 aa  194  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  49.76 
 
 		 249 aa  194  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0392  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 		 252 aa  194  7e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0748  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 		 252 aa  194  7e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.401665  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  50.71 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  48.33 
 
 		 278 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  49.53 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  50 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  50.48 
 
 		 269 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  49.53 
 
 		 265 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2415  transposase  46.95 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1035  transposase  46.01 
 
 		 273 aa  171  5.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0448539  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1085  transposase  46.01 
 
 		 273 aa  171  5.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>