More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0876 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0876  Integrase catalytic region  100 
 
 		 286 aa  597  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  59.93 
 
 		 289 aa  349  3e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  59.93 
 
 		 289 aa  349  3e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  61.15 
 
 		 280 aa  344  8e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  46.35 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0473  ISxac3 transposase  62.5 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  46.35 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  46.35 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  45.52 
 
 		 291 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  45.52 
 
 		 291 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  45.52 
 
 		 291 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  44.36 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  46.97 
 
 		 277 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  46.69 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  46.69 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  46.69 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  46.99 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  44.88 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  46.99 
 
 		 267 aa  220  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  46.99 
 
 		 267 aa  220  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  43.33 
 
 		 272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  47.01 
 
 		 271 aa  215  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  43.22 
 
 		 288 aa  215  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  40.28 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  44.92 
 
 		 279 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  42.15 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  42.34 
 
 		 277 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  42.08 
 
 		 383 aa  203  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  42.74 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  42.74 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  42.74 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  42.74 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  42.74 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  43.14 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  40.47 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  40.47 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  41.88 
 
 		 283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  41.88 
 
 		 283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  41.43 
 
 		 296 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  41.43 
 
 		 296 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  41.52 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  41.53 
 
 		 270 aa  198  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  41.53 
 
 		 270 aa  198  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  42.35 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  42.69 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  42.69 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  42.69 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  42.69 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  41.35 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  41.35 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  41.35 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  48.62 
 
 		 231 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  41.35 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  41.35 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  41.35 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  42.35 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2557  Integrase catalytic region  37.92 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  44.09 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  44.09 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  44.09 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  44.09 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  44.09 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  44.09 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  44.09 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  44.09 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  44.09 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  44.09 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  44.09 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  41.47 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  44.09 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  43.87 
 
 		 270 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  38.27 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  38.27 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  38.08 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  38.27 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  38.85 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  38.85 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  37.91 
 
 		 286 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  44.44 
 
 		 269 aa  185  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  37.91 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  37.91 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  37.91 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  37.91 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  37.91 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  37.91 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  37.91 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  38.27 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  40.71 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  40.71 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  40.71 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  40.71 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  40.71 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  43.51 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  39.71 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  39.31 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  38.02 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  38.02 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  38.02 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  38.02 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>