More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2366 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2366  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 325 aa  638    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.58 
 
 		 317 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4181  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.75 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.75 
 
 		 328 aa  288  6e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.85 
 
 		 328 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.63 
 
 		 329 aa  279  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00720  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.73 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.240367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5498  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.4 
 
 		 329 aa  277  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.0182886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1053  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.68 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1307  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.68 
 
 		 363 aa  276  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.111837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.51 
 
 		 342 aa  275  8e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.77 
 
 		 362 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.34 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.47 
 
 		 362 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.22 
 
 		 368 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.73 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.5 
 
 		 323 aa  268  5.9999999999999995e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.95 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.45 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.73 
 
 		 338 aa  266  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.91 
 
 		 368 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.86 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.46 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8229  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.02 
 
 		 342 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.55 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1105  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.79 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2129  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.72 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.02 
 
 		 361 aa  255  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.43 
 
 		 327 aa  255  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.46 
 
 		 348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.12 
 
 		 349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.21 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  38.46 
 
 		 348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4448  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.29 
 
 		 340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.55 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1249  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.29 
 
 		 355 aa  251  8.000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.2 
 
 		 327 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4424  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.99 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0017  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.57 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  39.12 
 
 		 373 aa  250  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2622  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.9 
 
 		 344 aa  250  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.3 
 
 		 345 aa  250  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11545  GDP-D-mannose dehydratase gmdA  44.04 
 
 		 340 aa  249  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.89 
 
 		 322 aa  249  4e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2872  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.64 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1288  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.26 
 
 		 361 aa  249  5e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.3 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1525  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.94 
 
 		 360 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.71 
 
 		 344 aa  248  8e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0059  GDP-D-mannose dehydratase  37.08 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0291032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.55 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.03 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4287  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.07 
 
 		 340 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3954  GDP-mannose 4,6-dehydratase  37.08 
 
 		 370 aa  246  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5682  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.96 
 
 		 323 aa  245  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.35 
 
 		 362 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6329  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.92 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.03 
 
 		 324 aa  245  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25417  gdp-mannose 4,6-dehydratase  39.14 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.807653  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.63 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000104251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.3 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1090  GDP-mannose 4,6-dehydratase  37.18 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.23 
 
 		 344 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.48 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3210  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.23 
 
 		 349 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.293077  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0522  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.06 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1762  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.12 
 
 		 349 aa  243  5e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319433 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0174  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.03 
 
 		 373 aa  242  6e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.338951  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2364  GDP-mannose 4,6-dehydratase  37.15 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000029315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.66 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.42 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0082  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.11 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.71 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5712  GDP-mannose 4,6-dehydratase (GDP-D-mannose dehydratase)  39.37 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.64 
 
 		 380 aa  240  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4203  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.77 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2614  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.59 
 
 		 342 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  37.29 
 
 		 375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.06 
 
 		 345 aa  239  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3251  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.18 
 
 		 372 aa  239  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14441  gdpmannose 4,6-dehydratase  36.92 
 
 		 364 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.327555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.31 
 
 		 320 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1221  GDP-mannose 4,6-dehydratase  36.78 
 
 		 355 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.155645  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0652  GDP-mannose 4,6-dehydratase  37.29 
 
 		 400 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.29 
 
 		 343 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4139  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.33 
 
 		 354 aa  238  6.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.927486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1311  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.88 
 
 		 360 aa  238  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.782429 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3372  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.48 
 
 		 371 aa  238  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1604  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.46 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.878549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2988  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.46 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343163 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2667  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.18 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2346  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.46 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0773  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.59 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1588  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.46 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2132  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.63 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0323729 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1179  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.46 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1009  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.46 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3411  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.44 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>