More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4182 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 317 aa  627  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2366  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.5 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.78 
 
 		 328 aa  293  4e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.77 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00720  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.1 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.240367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4181  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.47 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1053  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.35 
 
 		 333 aa  278  8e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1307  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.35 
 
 		 363 aa  278  9e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.111837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5498  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.26 
 
 		 329 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.0182886 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.85 
 
 		 359 aa  271  9e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8229  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.55 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.94 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.98 
 
 		 358 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.64 
 
 		 362 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.2 
 
 		 328 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.95 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.68 
 
 		 329 aa  263  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2872  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.71 
 
 		 340 aa  262  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.03 
 
 		 360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2622  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.96 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207032  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2129  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.65 
 
 		 347 aa  256  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.48 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.03 
 
 		 342 aa  256  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.94 
 
 		 330 aa  255  7e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.14 
 
 		 344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11545  GDP-D-mannose dehydratase gmdA  46.63 
 
 		 340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.28 
 
 		 343 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.35 
 
 		 361 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.88 
 
 		 368 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.28 
 
 		 345 aa  252  6e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.1 
 
 		 322 aa  252  7e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.2 
 
 		 328 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.9 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.52 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0963  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.9 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.6787 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.83 
 
 		 338 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.52 
 
 		 349 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.26 
 
 		 380 aa  250  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.74 
 
 		 324 aa  249  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  43.99 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.63 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.01 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.42 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0757  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.77 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.62 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.73 
 
 		 344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.26 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1069  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.15 
 
 		 347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.390497 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  41.1 
 
 		 348 aa  245  6.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.1 
 
 		 348 aa  245  6.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3277  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.36 
 
 		 344 aa  245  9e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4203  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.75 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1221  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.76 
 
 		 355 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.155645  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4754  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.44 
 
 		 350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.61 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.89 
 
 		 361 aa  242  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0017  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.15 
 
 		 364 aa  242  5e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.14 
 
 		 346 aa  242  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2132  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.36 
 
 		 348 aa  242  7e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0323729 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.76 
 
 		 362 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3251  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.69 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2614  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.52 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2667  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.69 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3358  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.49 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3372  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.49 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1762  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.05 
 
 		 349 aa  240  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319433 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.49 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3411  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.2 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3559  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.49 
 
 		 348 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0335248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.49 
 
 		 348 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3970  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.49 
 
 		 348 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.18 
 
 		 351 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.07 
 
 		 363 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2115  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.49 
 
 		 348 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1525  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.76 
 
 		 360 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  40.88 
 
 		 373 aa  239  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.44 
 
 		 375 aa  239  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6329  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.4 
 
 		 354 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.67 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2295  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.98 
 
 		 347 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0502351  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43847  predicted protein  42.4 
 
 		 362 aa  238  6.999999999999999e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.379971  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2434  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.69 
 
 		 347 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186201  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1709  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.69 
 
 		 347 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0269381  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1660  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.69 
 
 		 347 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1868  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.69 
 
 		 347 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350001  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0540  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.69 
 
 		 347 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0419  GDP-mannose 4,6-dehydratase Bme9  41.89 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.71 
 
 		 368 aa  238  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1090  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.94 
 
 		 370 aa  238  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1311  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.18 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.782429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1923  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.91 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.578659  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4012  GDP-mannose 4,6-dehydratase  39.43 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3190  GDP-mannose 4,6-dehydratase  40.23 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41976  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.96 
 
 		 332 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0229632  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.43 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0522  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.06 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.18 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0690  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.69 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00490394  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1271  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.77 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0368373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>