109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0486 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0486  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 661 aa  1327    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198617  normal  0.0627414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.49 
 
 		 1332 aa  79  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  27.43 
 
 		 971 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  22.53 
 
 		 1020 aa  75.1  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  28.88 
 
 		 969 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 2161 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 2783 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.25 
 
 		 713 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  29.28 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.25 
 
 		 704 aa  67  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  21.73 
 
 		 523 aa  65.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 880 aa  65.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  26.92 
 
 		 1142 aa  63.9  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.11 
 
 		 1089 aa  61.6  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 958 aa  61.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 911 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  25.27 
 
 		 1094 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 2153 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.41 
 
 		 957 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.48 
 
 		 1568 aa  57.8  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.89 
 
 		 678 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  20 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  20.43 
 
 		 611 aa  57.8  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4649  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 533 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 785 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  23.17 
 
 		 961 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  21.81 
 
 		 380 aa  54.3  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  23.76 
 
 		 638 aa  54.3  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.73 
 
 		 1080 aa  53.9  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 884 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  25 
 
 		 981 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.29 
 
 		 1016 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  29.66 
 
 		 1138 aa  52  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  23.18 
 
 		 546 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  26.75 
 
 		 696 aa  52  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  22.3 
 
 		 528 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 3470 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.44 
 
 		 1081 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.84 
 
 		 1087 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2866  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.41 
 
 		 448 aa  51.2  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 531 aa  51.2  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  24.18 
 
 		 614 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.02 
 
 		 577 aa  50.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 		 702 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  24.39 
 
 		 918 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  27.22 
 
 		 1027 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  22.87 
 
 		 665 aa  49.7  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  27.22 
 
 		 1027 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  27.22 
 
 		 1027 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  22 
 
 		 515 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  26.04 
 
 		 536 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25 
 
 		 1480 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.8 
 
 		 1226 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0907  putative PAS/PAC sensor protein  26.46 
 
 		 535 aa  48.9  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  28.28 
 
 		 1063 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.8 
 
 		 1004 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 		 1160 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  21.68 
 
 		 770 aa  48.5  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.38 
 
 		 1291 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  28 
 
 		 1914 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  26.38 
 
 		 533 aa  47.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.27 
 
 		 1017 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  24.73 
 
 		 582 aa  48.1  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.07 
 
 		 1014 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2470  diguanylate cyclase with GAF sensor  22.8 
 
 		 756 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.578353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1849  putative phytochrome sensor protein  31.3 
 
 		 359 aa  47.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1469  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.81 
 
 		 806 aa  47.4  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0948188  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  24.54 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  24.54 
 
 		 483 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.17 
 
 		 1141 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  29.88 
 
 		 1096 aa  47  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 1096 aa  47  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1738  diguanylate cyclase  22.22 
 
 		 462 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2079  sigma-54 dependent transcriptional regulator, putative  26.79 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  21.76 
 
 		 584 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  20.43 
 
 		 643 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  23.08 
 
 		 719 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 		 357 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 885 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 726 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.62189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  21.05 
 
 		 518 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  31.39 
 
 		 1046 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 1877 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2301  adenylate/guanylate cyclase  29.46 
 
 		 199 aa  45.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000915403  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  28.44 
 
 		 681 aa  45.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  26.02 
 
 		 817 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2966  transcriptional regulator NifA  29.71 
 
 		 515 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 		 819 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0816  hypothetical protein  23.84 
 
 		 230 aa  44.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  21.7 
 
 		 737 aa  44.7  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0979  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 374 aa  44.7  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  29.71 
 
 		 468 aa  44.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  26.67 
 
 		 1037 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 552 aa  44.3  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  24.14 
 
 		 746 aa  44.3  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  24.74 
 
 		 1093 aa  44.3  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 1519 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  22.03 
 
 		 284 aa  44.3  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0485  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  35.53 
 
 		 1011 aa  44.3  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 		 905 aa  44.3  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>