42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1849 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1849  putative phytochrome sensor protein  100 
 
 		 359 aa  724    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  32.85 
 
 		 971 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  32.85 
 
 		 969 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 545 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 544 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.24 
 
 		 961 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  30.11 
 
 		 981 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  30.47 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.32 
 
 		 885 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 545 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  27.04 
 
 		 718 aa  53.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  23.87 
 
 		 1004 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.49 
 
 		 880 aa  53.1  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.49 
 
 		 860 aa  53.1  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.91 
 
 		 957 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  28.83 
 
 		 357 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 666 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.518725  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2079  sigma-54 dependent transcriptional regulator, putative  25.7 
 
 		 505 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 548 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0029  putative GAF sensor protein  28.48 
 
 		 499 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.45 
 
 		 995 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  24.78 
 
 		 719 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.28 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 958 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  23.81 
 
 		 1017 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2248  putative GAF sensor protein  24.86 
 
 		 182 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  27.89 
 
 		 1020 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3102  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 		 1211 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 2783 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.9 
 
 		 3470 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 602 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.525886  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 636 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 1084 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 		 770 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0486  putative GAF sensor protein  32.67 
 
 		 661 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198617  normal  0.0627414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 785 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 911 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0377  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  24.06 
 
 		 876 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0140415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1361  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  23.08 
 
 		 744 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 		 1017 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0407  GGDEF domain-containing protein  26.67 
 
 		 873 aa  42.7  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0669941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>