More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE00140 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_53327  Dihydroxyacetone synthase (DHAS) (TKL2) (Formaldehyde transketolase) (Glycerone synthase)  47.63 
 
 
700 aa  644    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01730  conserved hypothetical protein  61.25 
 
 
725 aa  941    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00140  transketolase, putative  100 
 
 
720 aa  1504    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08551  dihydroxy-acetone synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02910)  47.92 
 
 
696 aa  629  1e-179  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.438181 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08935  conserved hypothetical protein  46.93 
 
 
719 aa  608  1e-173  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.510935  normal  0.132007 
 
 
-
 
NC_006686  CND00940  conserved hypothetical protein  43.18 
 
 
687 aa  568  1e-161  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.292242  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00688  transketolase TktA (AFU_orthologue; AFUA_1G13500)  42.28 
 
 
684 aa  541  9.999999999999999e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0372185  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  43.78 
 
 
668 aa  536  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  43.18 
 
 
670 aa  525  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  43.22 
 
 
668 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  43.22 
 
 
668 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0870  transketolase  43.93 
 
 
670 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  43.93 
 
 
670 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  42.47 
 
 
668 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  41.58 
 
 
670 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  41.58 
 
 
670 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  42.66 
 
 
669 aa  515  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  42.75 
 
 
670 aa  510  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  42 
 
 
666 aa  511  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  42.23 
 
 
666 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  42.66 
 
 
669 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  42.69 
 
 
672 aa  506  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  42.11 
 
 
668 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  42.08 
 
 
680 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  42.38 
 
 
666 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  42.23 
 
 
666 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  42.08 
 
 
666 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  42.38 
 
 
666 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  42.08 
 
 
666 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67105  transketolase 1  40.59 
 
 
677 aa  504  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  42.15 
 
 
669 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  41.85 
 
 
666 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  41.85 
 
 
666 aa  497  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  41.26 
 
 
680 aa  497  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  42.45 
 
 
668 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  42.14 
 
 
668 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1616  transketolase  42.14 
 
 
662 aa  490  1e-137  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  42.51 
 
 
669 aa  490  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  41.91 
 
 
668 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  42.15 
 
 
666 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  41.6 
 
 
666 aa  485  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  41.6 
 
 
666 aa  485  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  41.6 
 
 
671 aa  485  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16284  predicted protein  41.08 
 
 
679 aa  481  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  39.85 
 
 
668 aa  481  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  41.74 
 
 
691 aa  482  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  41.53 
 
 
662 aa  480  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  40.92 
 
 
666 aa  479  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  41.74 
 
 
691 aa  482  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  40.42 
 
 
669 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  41.65 
 
 
664 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29260  transketolase  39.07 
 
 
684 aa  476  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.029788  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  42.92 
 
 
662 aa  478  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4056  transketolase  40.52 
 
 
681 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  41.92 
 
 
667 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  41.92 
 
 
667 aa  472  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  42.07 
 
 
667 aa  474  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  42.01 
 
 
664 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02318  hypothetical protein  41.92 
 
 
667 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  40.83 
 
 
664 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  42.75 
 
 
663 aa  472  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3686  transketolase  42.07 
 
 
667 aa  474  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709027  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  41.38 
 
 
662 aa  475  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  42.86 
 
 
674 aa  475  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  41.92 
 
 
667 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  41.92 
 
 
667 aa  472  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  41.98 
 
 
667 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  40.54 
 
 
664 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  40.98 
 
 
664 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  40.98 
 
 
664 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  39.63 
 
 
707 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  42.35 
 
 
664 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  40.83 
 
 
664 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  41.32 
 
 
663 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  41.77 
 
 
667 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  41.34 
 
 
663 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  41.34 
 
 
663 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  41.34 
 
 
663 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  42.04 
 
 
665 aa  467  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  38.52 
 
 
662 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3900  transketolase  42.2 
 
 
664 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  41.67 
 
 
663 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2707  transketolase  41.26 
 
 
666 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  41.34 
 
 
663 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  42.5 
 
 
664 aa  469  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  40.86 
 
 
699 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  41.34 
 
 
663 aa  468  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  41.34 
 
 
663 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2840  transketolase  41.26 
 
 
666 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  40.83 
 
 
664 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  39.61 
 
 
660 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  40.95 
 
 
666 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2733  transketolase  41.26 
 
 
666 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2618  transketolase  41.26 
 
 
666 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  41.34 
 
 
663 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  41.34 
 
 
663 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  38.52 
 
 
662 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  41.84 
 
 
664 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  38.96 
 
 
662 aa  465  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  40.26 
 
 
680 aa  465  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.336202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>