More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1902 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1902  putative molybdenum ABC transporter, periplasmic binding protein  100 
 
 
256 aa  527  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130672  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2023  oxidoreductase  71.43 
 
 
253 aa  341  7e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0922  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.8 
 
 
256 aa  255  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.191979  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0885  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  52 
 
 
256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0698186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4450  oxidoreductase  51.6 
 
 
256 aa  250  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0191717  normal  0.678808 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.2 
 
 
256 aa  248  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 
255 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000567358  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.33 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.54 
 
 
266 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  39.06 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
277 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.02 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
263 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
239 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 
261 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 
264 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
259 aa  109  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
256 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  32.71 
 
 
259 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
258 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
268 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.700313  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
255 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
259 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  35.89 
 
 
239 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
245 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
272 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  34.95 
 
 
259 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.03 
 
 
243 aa  105  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
262 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
257 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
264 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036497  normal  0.609933 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
255 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
245 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
239 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
244 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
256 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
284 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
264 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
258 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
257 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
259 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
262 aa  102  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.17 
 
 
265 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  35.71 
 
 
239 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1864  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.83 
 
 
262 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
244 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
265 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
245 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.880926  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  33.33 
 
 
258 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  29.17 
 
 
265 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
271 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
244 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.98 
 
 
259 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
259 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 
259 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
243 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
260 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 
262 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 
262 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  33.33 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.79 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
266 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.91 
 
 
266 aa  99  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
259 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
259 aa  99  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
281 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
281 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 
262 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.42 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642907  decreased coverage  0.0040913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0189644  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 
271 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0125509  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  33.95 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  32.84 
 
 
259 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  32.8 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  33.8 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 
246 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.197421 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498015  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.97 
 
 
239 aa  96.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01250  short-chain dehydrogenase, putative  30.37 
 
 
282 aa  96.3  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
266 aa  96.3  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 
243 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
265 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.15353 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
260 aa  96.3  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>