More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3467 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  77.28 
 
 		 407 aa  651    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 409 aa  827    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  64.38 
 
 		 398 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  63.87 
 
 		 398 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  64.38 
 
 		 398 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  62.78 
 
 		 398 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  62.69 
 
 		 398 aa  497  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  61.52 
 
 		 396 aa  495  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  63.43 
 
 		 398 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  63.87 
 
 		 398 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  63.1 
 
 		 396 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  60.91 
 
 		 398 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  61.42 
 
 		 400 aa  482  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  61.93 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  61.93 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0158  phosphoglycerate kinase  62.63 
 
 		 400 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  60.66 
 
 		 398 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3241  phosphoglycerate kinase  59.19 
 
 		 400 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  60.31 
 
 		 395 aa  472  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  60.3 
 
 		 401 aa  471  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  59.8 
 
 		 395 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  59.29 
 
 		 400 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2106  phosphoglycerate kinase  57.07 
 
 		 402 aa  466  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.811046  normal  0.0646104 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2653  phosphoglycerate kinase  60.41 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3538  phosphoglycerate kinase  58.69 
 
 		 400 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  55.98 
 
 		 396 aa  440  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1318  phosphoglycerate kinase  56.6 
 
 		 398 aa  435  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.575519  normal  0.28013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0520  phosphoglycerate kinase  54.59 
 
 		 407 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0221  phosphoglycerate kinase  56.2 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2604  phosphoglycerate kinase  56.49 
 
 		 397 aa  418  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0140  phosphoglycerate kinase  52.3 
 
 		 400 aa  418  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1152  phosphoglycerate kinase  56.49 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4044  phosphoglycerate kinase  56.49 
 
 		 397 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1965  phosphoglycerate kinase  54.89 
 
 		 395 aa  413  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.159546  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1097  phosphoglycerate kinase  56.23 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1222  phosphoglycerate kinase  57.07 
 
 		 397 aa  411  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2596  phosphoglycerate kinase  52.15 
 
 		 403 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0449  phosphoglycerate kinase  51.78 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0576652  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0766  phosphoglycerate kinase  52.79 
 
 		 396 aa  398  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2155  phosphoglycerate kinase  54.43 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1694  phosphoglycerate kinase  53.03 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  51.28 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1918  phosphoglycerate kinase  54.96 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.253475 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  50.77 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.9 
 
 		 650 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  48.85 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.36 
 
 		 646 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  50.26 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  48.08 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  48.08 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  48.35 
 
 		 394 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  47.49 
 
 		 399 aa  363  3e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 		 393 aa  362  8e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  49.12 
 
 		 403 aa  362  8e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  47.83 
 
 		 394 aa  362  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  48.46 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  49.1 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  48.61 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  48.34 
 
 		 393 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  47.96 
 
 		 397 aa  358  8e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  46.43 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  46.31 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  47.18 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  47.45 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  47.19 
 
 		 389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  47.58 
 
 		 397 aa  353  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  47.19 
 
 		 394 aa  352  8.999999999999999e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  47.44 
 
 		 394 aa  349  6e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  46.75 
 
 		 400 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  49.23 
 
 		 396 aa  347  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  46.75 
 
 		 400 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  45.27 
 
 		 400 aa  345  8e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  46.62 
 
 		 401 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1398  Phosphoglycerate kinase  46.21 
 
 		 398 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  45.27 
 
 		 441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.23 
 
 		 655 aa  343  2.9999999999999997e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  46.84 
 
 		 399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  47.31 
 
 		 403 aa  343  4e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  47.45 
 
 		 393 aa  343  4e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  47.33 
 
 		 397 aa  342  8e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  47.84 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  46.08 
 
 		 402 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  46.46 
 
 		 398 aa  340  4e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  45.92 
 
 		 395 aa  339  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  46.11 
 
 		 435 aa  338  8e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  45.82 
 
 		 402 aa  338  8e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  47.33 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  46.43 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  45.69 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  47.07 
 
 		 396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2700  phosphoglycerate kinase  45.2 
 
 		 396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  45.43 
 
 		 397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  45.57 
 
 		 402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  46.82 
 
 		 396 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  45.15 
 
 		 402 aa  335  1e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0977  phosphoglycerate kinase  44.27 
 
 		 395 aa  334  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>