More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6003 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 398 aa  788    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  94.21 
 
 		 398 aa  751    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  78.64 
 
 		 400 aa  624  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  78.64 
 
 		 400 aa  623  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  78.64 
 
 		 400 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  74.94 
 
 		 398 aa  595  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  73.67 
 
 		 398 aa  587  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  73.12 
 
 		 398 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  71.28 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0158  phosphoglycerate kinase  75.63 
 
 		 400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  71.61 
 
 		 398 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  73.6 
 
 		 398 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  70.85 
 
 		 398 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  68.78 
 
 		 395 aa  549  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  69.67 
 
 		 401 aa  548  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  68.02 
 
 		 395 aa  546  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  68.18 
 
 		 400 aa  541  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3241  phosphoglycerate kinase  69.1 
 
 		 400 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  67.25 
 
 		 398 aa  532  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  68.01 
 
 		 396 aa  528  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2653  phosphoglycerate kinase  70.05 
 
 		 399 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3538  phosphoglycerate kinase  67.84 
 
 		 400 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  60.66 
 
 		 409 aa  487  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2106  phosphoglycerate kinase  63.66 
 
 		 402 aa  488  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.811046  normal  0.0646104 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  61.68 
 
 		 396 aa  482  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  60.91 
 
 		 407 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1318  phosphoglycerate kinase  64.32 
 
 		 398 aa  473  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.575519  normal  0.28013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0520  phosphoglycerate kinase  59.8 
 
 		 407 aa  468  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2604  phosphoglycerate kinase  63.54 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0140  phosphoglycerate kinase  56.09 
 
 		 400 aa  461  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0221  phosphoglycerate kinase  60.96 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0766  phosphoglycerate kinase  60.15 
 
 		 396 aa  451  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1222  phosphoglycerate kinase  61.62 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1965  phosphoglycerate kinase  60.51 
 
 		 395 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.159546  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1097  phosphoglycerate kinase  62.28 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2596  phosphoglycerate kinase  57.83 
 
 		 403 aa  436  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1152  phosphoglycerate kinase  62.18 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4044  phosphoglycerate kinase  62.18 
 
 		 397 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1694  phosphoglycerate kinase  61.87 
 
 		 396 aa  430  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2155  phosphoglycerate kinase  60.76 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0449  phosphoglycerate kinase  56.48 
 
 		 400 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0576652  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1918  phosphoglycerate kinase  60.2 
 
 		 398 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.253475 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  54.99 
 
 		 393 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  51.77 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  52.19 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  51.04 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  51.66 
 
 		 395 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.11 
 
 		 650 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  48.32 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  49.11 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  49.22 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  49.22 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  52.5 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 400 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  49.11 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  48.19 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 396 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  47.85 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  46.75 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  49.09 
 
 		 394 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  50.39 
 
 		 401 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.61 
 
 		 646 aa  365  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  46.63 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  47.61 
 
 		 397 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  48.18 
 
 		 393 aa  362  6e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  45.04 
 
 		 393 aa  362  6e-99  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1617  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 397 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0893272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  46.84 
 
 		 399 aa  362  8e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 		 401 aa  362  9e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 		 401 aa  361  2e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 		 403 aa  360  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  49.1 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  46.63 
 
 		 400 aa  359  4e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  49.23 
 
 		 394 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  48.58 
 
 		 401 aa  359  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  49.22 
 
 		 393 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  47.06 
 
 		 402 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  46.94 
 
 		 399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  47.15 
 
 		 399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  48.61 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  46.08 
 
 		 399 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  47.22 
 
 		 397 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  47.81 
 
 		 402 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  48.49 
 
 		 398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  45.82 
 
 		 399 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  47.15 
 
 		 398 aa  355  7.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  48.35 
 
 		 397 aa  355  7.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  45.82 
 
 		 398 aa  354  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2842  phosphoglycerate kinase  50.9 
 
 		 392 aa  354  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  47.29 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 406 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 		 401 aa  352  8e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  48.84 
 
 		 400 aa  352  8.999999999999999e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0677  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 396 aa  351  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  46.55 
 
 		 402 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  45.82 
 
 		 397 aa  350  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.41 
 
 		 655 aa  350  3e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 654 aa  349  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  46.37 
 
 		 394 aa  349  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>