More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2155 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2155  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 393 aa  781    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  71.14 
 
 		 396 aa  564  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1694  phosphoglycerate kinase  73.79 
 
 		 396 aa  541  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1152  phosphoglycerate kinase  74.24 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4044  phosphoglycerate kinase  73.99 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1097  phosphoglycerate kinase  73.67 
 
 		 397 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1918  phosphoglycerate kinase  71.76 
 
 		 398 aa  502  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.253475 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  63.1 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  63.96 
 
 		 398 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3241  phosphoglycerate kinase  62.47 
 
 		 400 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  63.1 
 
 		 395 aa  471  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2653  phosphoglycerate kinase  63.89 
 
 		 399 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  63 
 
 		 401 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  62.34 
 
 		 395 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  61.77 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  61.77 
 
 		 400 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  61.52 
 
 		 400 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  60.51 
 
 		 398 aa  455  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  61.73 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3538  phosphoglycerate kinase  61.21 
 
 		 400 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0520  phosphoglycerate kinase  59.39 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1965  phosphoglycerate kinase  60.41 
 
 		 395 aa  450  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.159546  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  59.49 
 
 		 398 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  60.76 
 
 		 398 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0221  phosphoglycerate kinase  60.91 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1318  phosphoglycerate kinase  60.51 
 
 		 398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.575519  normal  0.28013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  59.54 
 
 		 396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  60.15 
 
 		 398 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  59.64 
 
 		 398 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  60.05 
 
 		 398 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2604  phosphoglycerate kinase  60.2 
 
 		 397 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0158  phosphoglycerate kinase  60.51 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  58.88 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2106  phosphoglycerate kinase  57.93 
 
 		 402 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.811046  normal  0.0646104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0766  phosphoglycerate kinase  59.49 
 
 		 396 aa  425  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  54.43 
 
 		 409 aa  421  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  59.9 
 
 		 398 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1222  phosphoglycerate kinase  59.69 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2596  phosphoglycerate kinase  58.31 
 
 		 403 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  54.2 
 
 		 407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0140  phosphoglycerate kinase  51.78 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0449  phosphoglycerate kinase  52.66 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0576652  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  53.15 
 
 		 392 aa  381  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  48.61 
 
 		 394 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  46.95 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  48.1 
 
 		 399 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  51.02 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  47.85 
 
 		 399 aa  356  5e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 394 aa  355  8.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  49.12 
 
 		 395 aa  353  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  46.17 
 
 		 393 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 395 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  46.7 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  47.34 
 
 		 393 aa  349  5e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  47.84 
 
 		 389 aa  347  1e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  46.21 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  48.25 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.08 
 
 		 650 aa  347  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  47.22 
 
 		 395 aa  347  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  46.56 
 
 		 389 aa  346  5e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  47.21 
 
 		 393 aa  345  5e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  48.26 
 
 		 402 aa  345  5e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  46.31 
 
 		 394 aa  344  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  48.23 
 
 		 402 aa  343  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0479  Phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 		 389 aa  342  5e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 655 aa  342  5e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  47.22 
 
 		 397 aa  342  5e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  48.59 
 
 		 401 aa  341  1e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  46.72 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  47.36 
 
 		 395 aa  340  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  45.96 
 
 		 402 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  47.29 
 
 		 402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  46.37 
 
 		 400 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  46.37 
 
 		 400 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03158  3-phosphoglycerate kinase  46.06 
 
 		 391 aa  338  9e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  47.47 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1041  phosphoglycerate kinase  47.59 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  44.62 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 		 392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  47.22 
 
 		 395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  47.56 
 
 		 401 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  45.77 
 
 		 401 aa  336  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  44.92 
 
 		 394 aa  335  7e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  44.67 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  45.36 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  48.84 
 
 		 401 aa  333  3e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1324  phosphoglycerate kinase  44.56 
 
 		 396 aa  333  4e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0186876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  44.42 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  44.16 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  45.36 
 
 		 402 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2021  phosphoglycerate kinase  46.7 
 
 		 391 aa  332  6e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  44.16 
 
 		 394 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  43.91 
 
 		 394 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  45.11 
 
 		 402 aa  332  8e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  44.42 
 
 		 394 aa  332  9e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  44.42 
 
 		 394 aa  332  9e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  45.27 
 
 		 401 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  44.16 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  45.27 
 
 		 401 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  43.65 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>