More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1729 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
395 aa  793    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  99.24 
 
 
395 aa  788    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  92.23 
 
 
401 aa  733    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  68.61 
 
 
400 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3241  phosphoglycerate kinase  70.05 
 
 
400 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  68.7 
 
 
398 aa  551  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  69.29 
 
 
398 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  69.21 
 
 
396 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  68.7 
 
 
398 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  69.47 
 
 
398 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  69.11 
 
 
398 aa  549  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  68.19 
 
 
398 aa  545  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  69.97 
 
 
398 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2653  phosphoglycerate kinase  70.63 
 
 
399 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  69.29 
 
 
400 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  68.02 
 
 
398 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  68.27 
 
 
400 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  68.53 
 
 
400 aa  535  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  67.94 
 
 
398 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3538  phosphoglycerate kinase  68.78 
 
 
400 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0158  phosphoglycerate kinase  69.04 
 
 
400 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  62.94 
 
 
396 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  61.32 
 
 
396 aa  484  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0520  phosphoglycerate kinase  61.99 
 
 
407 aa  481  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2106  phosphoglycerate kinase  60.3 
 
 
402 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.811046  normal  0.0646104 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0140  phosphoglycerate kinase  57.36 
 
 
400 aa  472  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  59.8 
 
 
409 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1318  phosphoglycerate kinase  62.94 
 
 
398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.575519  normal  0.28013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  59.8 
 
 
407 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2604  phosphoglycerate kinase  62.94 
 
 
397 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0451422  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1965  phosphoglycerate kinase  61.77 
 
 
395 aa  453  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.159546  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0221  phosphoglycerate kinase  58.52 
 
 
397 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1222  phosphoglycerate kinase  61.73 
 
 
397 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0766  phosphoglycerate kinase  59.29 
 
 
396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1152  phosphoglycerate kinase  61.83 
 
 
397 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1097  phosphoglycerate kinase  61.58 
 
 
397 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4044  phosphoglycerate kinase  61.58 
 
 
397 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2596  phosphoglycerate kinase  57.33 
 
 
403 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2155  phosphoglycerate kinase  62.34 
 
 
393 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1694  phosphoglycerate kinase  60.05 
 
 
396 aa  429  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1918  phosphoglycerate kinase  61.93 
 
 
398 aa  428  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.253475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0449  phosphoglycerate kinase  52.16 
 
 
400 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0576652  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.26 
 
 
650 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  49.24 
 
 
393 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 
395 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  51.28 
 
 
393 aa  364  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  50 
 
 
394 aa  364  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 
392 aa  363  3e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 
397 aa  361  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  49.11 
 
 
395 aa  361  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  47.74 
 
 
394 aa  360  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  45.96 
 
 
394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  48.08 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  48.08 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  48.21 
 
 
393 aa  355  5e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  46.15 
 
 
443 aa  353  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  47.94 
 
 
394 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.45 
 
 
646 aa  352  7e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  47.34 
 
 
400 aa  351  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 
401 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  45.64 
 
 
399 aa  350  2e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  47.44 
 
 
396 aa  351  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  46.56 
 
 
394 aa  349  5e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 
400 aa  349  5e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  47.81 
 
 
396 aa  349  6e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  48.37 
 
 
403 aa  347  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  46.06 
 
 
397 aa  345  6e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  47.19 
 
 
401 aa  345  8e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  45.55 
 
 
397 aa  345  8.999999999999999e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  47.7 
 
 
396 aa  345  8.999999999999999e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  47.26 
 
 
402 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  48.09 
 
 
400 aa  343  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  45.43 
 
 
402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  47.45 
 
 
402 aa  343  4e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  44.7 
 
 
402 aa  342  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  46.95 
 
 
394 aa  342  5.999999999999999e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  45.43 
 
 
402 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  49.11 
 
 
406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  44.92 
 
 
402 aa  339  5e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  45.78 
 
 
394 aa  338  7e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  46.04 
 
 
394 aa  338  8e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  46.04 
 
 
394 aa  338  8e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  45.01 
 
 
393 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1167  phosphoglycerate kinase  43.69 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  45.88 
 
 
399 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0677  phosphoglycerate kinase  48.23 
 
 
396 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  45.88 
 
 
399 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  45.78 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  45.27 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  45.27 
 
 
394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  45.2 
 
 
398 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1398  Phosphoglycerate kinase  46.33 
 
 
398 aa  335  7e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  45.27 
 
 
394 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  45.27 
 
 
394 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  46.48 
 
 
401 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  44.76 
 
 
394 aa  333  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  46.94 
 
 
401 aa  334  2e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  45.94 
 
 
399 aa  334  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  45.52 
 
 
397 aa  334  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  45.8 
 
 
398 aa  333  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>