More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7284 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 398 aa  791    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  94.21 
 
 		 398 aa  740    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  77.33 
 
 		 400 aa  615  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  77.33 
 
 		 400 aa  616  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  77.33 
 
 		 400 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  74.62 
 
 		 398 aa  591  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  74.37 
 
 		 398 aa  587  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  72.93 
 
 		 398 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  71.61 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0158  phosphoglycerate kinase  74.81 
 
 		 400 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  70.93 
 
 		 398 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  74.11 
 
 		 398 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  70.68 
 
 		 398 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  70.05 
 
 		 395 aa  554  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  69.29 
 
 		 395 aa  551  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  70.43 
 
 		 401 aa  551  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  67.42 
 
 		 400 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  67.51 
 
 		 398 aa  531  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3241  phosphoglycerate kinase  69.02 
 
 		 400 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2653  phosphoglycerate kinase  70.81 
 
 		 399 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  67.51 
 
 		 396 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3538  phosphoglycerate kinase  68.01 
 
 		 400 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2106  phosphoglycerate kinase  63.66 
 
 		 402 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.811046  normal  0.0646104 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  60.91 
 
 		 409 aa  485  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  61.17 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  61.27 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0520  phosphoglycerate kinase  61.07 
 
 		 407 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0221  phosphoglycerate kinase  61.46 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1318  phosphoglycerate kinase  62.47 
 
 		 398 aa  463  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.575519  normal  0.28013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0766  phosphoglycerate kinase  60.76 
 
 		 396 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1965  phosphoglycerate kinase  61.52 
 
 		 395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.159546  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2604  phosphoglycerate kinase  63.1 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0140  phosphoglycerate kinase  55.84 
 
 		 400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1222  phosphoglycerate kinase  61.62 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1152  phosphoglycerate kinase  63.13 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4044  phosphoglycerate kinase  62.88 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1097  phosphoglycerate kinase  62.37 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1694  phosphoglycerate kinase  62.53 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2596  phosphoglycerate kinase  57.32 
 
 		 403 aa  433  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0449  phosphoglycerate kinase  55.96 
 
 		 400 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0576652  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2155  phosphoglycerate kinase  60.15 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1918  phosphoglycerate kinase  60.2 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.253475 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  51.77 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  53.45 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  51.55 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  50.52 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  50.52 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.85 
 
 		 650 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  51.41 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  49.36 
 
 		 394 aa  371  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  51.16 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  48.32 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  48.36 
 
 		 397 aa  368  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 		 401 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  47.5 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  47.93 
 
 		 397 aa  363  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 403 aa  363  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  47.85 
 
 		 397 aa  363  4e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 		 401 aa  362  6e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  48.23 
 
 		 399 aa  361  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  51 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  48.84 
 
 		 397 aa  361  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1617  phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 		 397 aa  360  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0893272  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  45.18 
 
 		 393 aa  360  4e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  46.63 
 
 		 396 aa  359  6e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  47.4 
 
 		 393 aa  358  7e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.19 
 
 		 655 aa  358  9e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 		 401 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.1 
 
 		 646 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  47.57 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  47.67 
 
 		 394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  48.83 
 
 		 394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  47.67 
 
 		 394 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  47.67 
 
 		 394 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  47.22 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 		 401 aa  353  2e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  47.15 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 		 401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  47.15 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  47.41 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  46.63 
 
 		 400 aa  352  4e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2842  phosphoglycerate kinase  50.77 
 
 		 392 aa  352  4e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  47.15 
 
 		 394 aa  353  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  47.93 
 
 		 393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  47.15 
 
 		 394 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  46.7 
 
 		 399 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  47.15 
 
 		 394 aa  352  7e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  46.33 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  47.15 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  46.33 
 
 		 399 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  47.15 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  49.61 
 
 		 400 aa  350  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0677  phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 		 396 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  47.99 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  48.47 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  46.94 
 
 		 399 aa  350  3e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>