More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2106 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2106  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 402 aa  805    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.811046  normal  0.0646104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  63.34 
 
 		 398 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  64.09 
 
 		 400 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  63.91 
 
 		 400 aa  508  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  63.91 
 
 		 400 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3241  phosphoglycerate kinase  63.75 
 
 		 400 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  63.91 
 
 		 400 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  63.66 
 
 		 398 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  62.88 
 
 		 398 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2653  phosphoglycerate kinase  63.57 
 
 		 399 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  62.09 
 
 		 396 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  62.63 
 
 		 398 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  60.8 
 
 		 395 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  63.66 
 
 		 398 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  60.3 
 
 		 395 aa  487  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  62.37 
 
 		 398 aa  487  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  60.3 
 
 		 401 aa  485  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0158  phosphoglycerate kinase  63.91 
 
 		 400 aa  484  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3538  phosphoglycerate kinase  63 
 
 		 400 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  61.62 
 
 		 398 aa  483  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  62.47 
 
 		 398 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  60.4 
 
 		 396 aa  478  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  57.07 
 
 		 409 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0520  phosphoglycerate kinase  61.11 
 
 		 407 aa  477  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  61.11 
 
 		 398 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  59.7 
 
 		 396 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  57.58 
 
 		 407 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1097  phosphoglycerate kinase  62.56 
 
 		 397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1152  phosphoglycerate kinase  62.31 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4044  phosphoglycerate kinase  62.31 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0221  phosphoglycerate kinase  58.75 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0140  phosphoglycerate kinase  53.27 
 
 		 400 aa  449  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1318  phosphoglycerate kinase  59.9 
 
 		 398 aa  444  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.575519  normal  0.28013 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1222  phosphoglycerate kinase  60 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1965  phosphoglycerate kinase  60.2 
 
 		 395 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.159546  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2596  phosphoglycerate kinase  58.38 
 
 		 403 aa  441  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2604  phosphoglycerate kinase  59.45 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1918  phosphoglycerate kinase  60.35 
 
 		 398 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.253475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1694  phosphoglycerate kinase  59.95 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0766  phosphoglycerate kinase  55.81 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2155  phosphoglycerate kinase  57.93 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0449  phosphoglycerate kinase  54.15 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0576652  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 392 aa  381  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.23 
 
 		 650 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  47.38 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  47.4 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  49.11 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  46.9 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  47.8 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  48.05 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  46.35 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  48.05 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  48.13 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 		 394 aa  363  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.53 
 
 		 655 aa  363  3e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  47.81 
 
 		 397 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  45.84 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  46.65 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  46.65 
 
 		 399 aa  360  3e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  46.6 
 
 		 401 aa  358  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  46.73 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  48.11 
 
 		 402 aa  354  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  48.22 
 
 		 403 aa  353  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1167  phosphoglycerate kinase  45.57 
 
 		 398 aa  353  4e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  46.77 
 
 		 399 aa  353  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  46.77 
 
 		 399 aa  352  8e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  46.13 
 
 		 402 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  46.5 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  46.89 
 
 		 441 aa  350  2e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  47.83 
 
 		 401 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  46.25 
 
 		 402 aa  350  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  46.07 
 
 		 399 aa  349  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  47.83 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.75 
 
 		 646 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  45.78 
 
 		 402 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  45.89 
 
 		 402 aa  346  4e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  44.72 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  45.99 
 
 		 402 aa  346  5e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  46.23 
 
 		 398 aa  345  8e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  47.24 
 
 		 395 aa  345  8.999999999999999e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  47.25 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  47.13 
 
 		 394 aa  345  1e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  49 
 
 		 406 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  45.99 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0977  phosphoglycerate kinase  44.97 
 
 		 395 aa  343  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  44.33 
 
 		 394 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  47.57 
 
 		 400 aa  343  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  48.19 
 
 		 401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  45.48 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  45.48 
 
 		 402 aa  342  5e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  47.86 
 
 		 393 aa  342  5.999999999999999e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  44.73 
 
 		 398 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  45.14 
 
 		 397 aa  342  8e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  46.02 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0677  phosphoglycerate kinase  47.03 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  48.19 
 
 		 401 aa  340  2e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  43.98 
 
 		 393 aa  341  2e-92  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1617  phosphoglycerate kinase  47.15 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0893272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>