More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0449 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0449  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 400 aa  799    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0576652  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  54.55 
 
 		 396 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  55.33 
 
 		 398 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  52.54 
 
 		 398 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  55.96 
 
 		 398 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  53.05 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  53.3 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  53.03 
 
 		 400 aa  411  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  56.48 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0221  phosphoglycerate kinase  54.06 
 
 		 397 aa  411  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0520  phosphoglycerate kinase  52.54 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0158  phosphoglycerate kinase  57.66 
 
 		 400 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  53.55 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  51.78 
 
 		 409 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  55.58 
 
 		 400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  55.58 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  55.58 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  53.81 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  52.03 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  51.65 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  51.66 
 
 		 407 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  52.16 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2653  phosphoglycerate kinase  53.28 
 
 		 399 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  52.42 
 
 		 395 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3241  phosphoglycerate kinase  52.41 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2106  phosphoglycerate kinase  54.15 
 
 		 402 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.811046  normal  0.0646104 
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  52.16 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  52.25 
 
 		 401 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4044  phosphoglycerate kinase  53.67 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1152  phosphoglycerate kinase  53.67 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0140  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1097  phosphoglycerate kinase  53.03 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3538  phosphoglycerate kinase  52.41 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2596  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 403 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1918  phosphoglycerate kinase  56.35 
 
 		 398 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.253475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1694  phosphoglycerate kinase  53.92 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1965  phosphoglycerate kinase  52.12 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.159546  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1318  phosphoglycerate kinase  53.3 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.575519  normal  0.28013 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1222  phosphoglycerate kinase  51.81 
 
 		 397 aa  363  3e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2155  phosphoglycerate kinase  52.66 
 
 		 393 aa  359  4e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 		 392 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  46.73 
 
 		 400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2604  phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 		 397 aa  355  8.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  45.55 
 
 		 393 aa  353  4e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0766  phosphoglycerate kinase  47.09 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  45.57 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  45.57 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  45.57 
 
 		 394 aa  346  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  45.57 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  45.57 
 
 		 394 aa  345  6e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  45.32 
 
 		 394 aa  344  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  45.32 
 
 		 394 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  45.32 
 
 		 394 aa  344  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  45.96 
 
 		 395 aa  344  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  44.56 
 
 		 394 aa  342  8e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  44.81 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  44.81 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.3 
 
 		 650 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  44.81 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  45.29 
 
 		 399 aa  341  2e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  45.29 
 
 		 399 aa  340  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  46.72 
 
 		 395 aa  339  5e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  44.13 
 
 		 394 aa  339  5e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.47 
 
 		 655 aa  339  5.9999999999999996e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  43.83 
 
 		 402 aa  339  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  45.57 
 
 		 393 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  43.58 
 
 		 402 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  44.36 
 
 		 399 aa  335  5.999999999999999e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  45.52 
 
 		 400 aa  335  5.999999999999999e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  46.08 
 
 		 401 aa  335  7e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  44.92 
 
 		 396 aa  335  7e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  43.83 
 
 		 402 aa  335  7e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  44.42 
 
 		 393 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  45.32 
 
 		 401 aa  333  2e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  44.67 
 
 		 394 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  43.29 
 
 		 402 aa  333  3e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  45.43 
 
 		 394 aa  332  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  45.57 
 
 		 401 aa  331  1e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  46.7 
 
 		 393 aa  331  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0152  phosphoglycerate kinase  45.73 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  44.05 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  45.06 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  46.21 
 
 		 394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  43.5 
 
 		 398 aa  329  6e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  44.84 
 
 		 397 aa  329  6e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  43.32 
 
 		 402 aa  328  8e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  42.57 
 
 		 393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0137  phosphoglycerate kinase  45.48 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  44.56 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  42.78 
 
 		 646 aa  327  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  45.96 
 
 		 395 aa  326  5e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  42.13 
 
 		 394 aa  325  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  45.16 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0977  phosphoglycerate kinase  44.05 
 
 		 395 aa  324  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0055  phosphoglycerate kinase  41.88 
 
 		 383 aa  323  2e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.186403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  43.43 
 
 		 394 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  43.83 
 
 		 397 aa  323  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  43.94 
 
 		 394 aa  323  5e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1979  phosphoglycerate kinase  43.51 
 
 		 399 aa  322  6e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.577028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  43.32 
 
 		 395 aa  322  7e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>