More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3533 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  83.92 
 
 		 398 aa  672    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  92.71 
 
 		 398 aa  750    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  82.66 
 
 		 398 aa  679    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  80.9 
 
 		 398 aa  653    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  83.92 
 
 		 398 aa  686    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 398 aa  797    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  85.97 
 
 		 396 aa  692    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  74.37 
 
 		 398 aa  587  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  73.67 
 
 		 398 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  71.75 
 
 		 400 aa  555  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  70.18 
 
 		 401 aa  555  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  72 
 
 		 400 aa  555  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  72 
 
 		 400 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  68.96 
 
 		 395 aa  548  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  68.19 
 
 		 395 aa  545  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  70.56 
 
 		 400 aa  545  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0158  phosphoglycerate kinase  71.86 
 
 		 400 aa  542  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  69.04 
 
 		 398 aa  526  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3241  phosphoglycerate kinase  68.69 
 
 		 400 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  65.74 
 
 		 396 aa  519  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2653  phosphoglycerate kinase  67.76 
 
 		 399 aa  512  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  62.78 
 
 		 409 aa  499  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3538  phosphoglycerate kinase  67.93 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2106  phosphoglycerate kinase  62.37 
 
 		 402 aa  472  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.811046  normal  0.0646104 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0520  phosphoglycerate kinase  59.8 
 
 		 407 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  60.56 
 
 		 396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  59.3 
 
 		 407 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0221  phosphoglycerate kinase  60.15 
 
 		 397 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0140  phosphoglycerate kinase  56.89 
 
 		 400 aa  465  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2604  phosphoglycerate kinase  63.89 
 
 		 397 aa  455  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1965  phosphoglycerate kinase  61.36 
 
 		 395 aa  450  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.159546  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1097  phosphoglycerate kinase  62.85 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1318  phosphoglycerate kinase  59.19 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.575519  normal  0.28013 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1152  phosphoglycerate kinase  62.85 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1222  phosphoglycerate kinase  61.99 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4044  phosphoglycerate kinase  62.6 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0766  phosphoglycerate kinase  57.76 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2596  phosphoglycerate kinase  56.78 
 
 		 403 aa  425  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1918  phosphoglycerate kinase  60 
 
 		 398 aa  425  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.253475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1694  phosphoglycerate kinase  59.14 
 
 		 396 aa  418  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2155  phosphoglycerate kinase  59.49 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0449  phosphoglycerate kinase  52.54 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0576652  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  49.5 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  51.01 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  48.63 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  47.61 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  47.34 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  47.31 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03315  phosphoglycerate kinase  45.82 
 
 		 420 aa  365  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  48.22 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  48.22 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  49.11 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  47.31 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  47.21 
 
 		 397 aa  364  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  48.73 
 
 		 394 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  47.34 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  47.59 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  46.56 
 
 		 397 aa  358  8e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.09 
 
 		 650 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  47.46 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  49.5 
 
 		 403 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 		 402 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1324  phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0186876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  47.31 
 
 		 397 aa  355  5e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1167  phosphoglycerate kinase  45.29 
 
 		 398 aa  356  5e-97  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  48.49 
 
 		 401 aa  356  5e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0977  phosphoglycerate kinase  46.67 
 
 		 395 aa  355  5.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  45.94 
 
 		 394 aa  355  7.999999999999999e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.84 
 
 		 646 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  48.1 
 
 		 400 aa  354  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  47.47 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  47.59 
 
 		 396 aa  352  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  45.29 
 
 		 394 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  47.34 
 
 		 402 aa  352  5e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  48.86 
 
 		 396 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  46.45 
 
 		 394 aa  352  8e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  47.34 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  46.7 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  46.7 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  48.34 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  46.45 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  48.61 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  46.45 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  47.85 
 
 		 401 aa  349  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  46.19 
 
 		 394 aa  349  5e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  48.35 
 
 		 396 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.21 
 
 		 655 aa  349  6e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  46.19 
 
 		 394 aa  348  7e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  48.36 
 
 		 396 aa  348  7e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  46.19 
 
 		 394 aa  348  8e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  48.35 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  46.82 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  46.84 
 
 		 395 aa  347  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  46.7 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>