More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03315 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03315  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
420 aa  848    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0977  phosphoglycerate kinase  72.91 
 
 
395 aa  596  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1324  phosphoglycerate kinase  68.43 
 
 
396 aa  548  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0186876  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  59.24 
 
 
395 aa  488  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2229  phosphoglycerate kinase  60.15 
 
 
395 aa  488  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1398  Phosphoglycerate kinase  60.2 
 
 
398 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  56.93 
 
 
397 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2700  phosphoglycerate kinase  56.46 
 
 
396 aa  462  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1677  phosphoglycerate kinase  52.64 
 
 
418 aa  448  1e-125  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.575292 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0736  hypothetical protein  52.42 
 
 
401 aa  424  1e-117  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 
397 aa  417  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 
402 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  51.13 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  50.76 
 
 
401 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 
397 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 
400 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 
400 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  51.78 
 
 
399 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 
401 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  52.16 
 
 
393 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  51.52 
 
 
399 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 
397 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  48.99 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.5 
 
 
646 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  47.97 
 
 
397 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 
394 aa  398  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 
394 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  47.22 
 
 
401 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  48.22 
 
 
394 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  47.73 
 
 
401 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 
399 aa  394  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  48.13 
 
 
402 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  47.99 
 
 
402 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  47.73 
 
 
401 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 
394 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  50 
 
 
395 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 
393 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  47.97 
 
 
394 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  48.22 
 
 
394 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  47.97 
 
 
394 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  49.24 
 
 
394 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  48.86 
 
 
400 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  47.97 
 
 
394 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  48.22 
 
 
394 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  48.21 
 
 
435 aa  390  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  47.63 
 
 
402 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  47.97 
 
 
394 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  47.97 
 
 
394 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  48.86 
 
 
396 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  45.71 
 
 
402 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  47.72 
 
 
394 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  48.99 
 
 
396 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  46.7 
 
 
397 aa  385  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  46.33 
 
 
401 aa  388  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  48.73 
 
 
393 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  48.22 
 
 
397 aa  386  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  47.72 
 
 
394 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  47.85 
 
 
396 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1715  phosphoglycerate kinase  48.93 
 
 
419 aa  382  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  48.22 
 
 
393 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.76 
 
 
655 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  46.88 
 
 
402 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  50.77 
 
 
402 aa  381  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  49.24 
 
 
398 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  46.97 
 
 
395 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.11 
 
 
650 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  47.38 
 
 
406 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  47.34 
 
 
400 aa  375  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 
397 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  47.98 
 
 
395 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  46.85 
 
 
392 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  49.26 
 
 
397 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  49.26 
 
 
397 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  46.58 
 
 
397 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  48.73 
 
 
400 aa  375  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  45.96 
 
 
395 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  47.97 
 
 
394 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  48.22 
 
 
394 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  46.39 
 
 
399 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  45.73 
 
 
396 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  45.36 
 
 
396 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  45.61 
 
 
396 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  47.85 
 
 
394 aa  372  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  45.61 
 
 
396 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  47.74 
 
 
403 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  45.64 
 
 
443 aa  368  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  46.39 
 
 
399 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  48.49 
 
 
395 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2515  phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 
397 aa  370  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  47.86 
 
 
441 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  45.62 
 
 
399 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2123  phosphoglycerate kinase  48.21 
 
 
397 aa  366  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357501  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  45.84 
 
 
389 aa  365  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  48.87 
 
 
399 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  45.82 
 
 
398 aa  365  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1418  Phosphoglycerate kinase  48.11 
 
 
403 aa  361  1e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0638  phosphoglycerate kinase  47.3 
 
 
404 aa  362  1e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0343575  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01246  Phosphoglycerate kinase (EC 2.7.2.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P11977]  47.74 
 
 
421 aa  360  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  45.06 
 
 
399 aa  360  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  48.49 
 
 
398 aa  361  2e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>