More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2700 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2700  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
396 aa  801    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  76.46 
 
 
395 aa  632  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2229  phosphoglycerate kinase  72.66 
 
 
395 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  69.7 
 
 
397 aa  558  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1398  Phosphoglycerate kinase  65.83 
 
 
398 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1324  phosphoglycerate kinase  57.32 
 
 
396 aa  474  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0186876  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03315  phosphoglycerate kinase  56.46 
 
 
420 aa  462  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0977  phosphoglycerate kinase  57.22 
 
 
395 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1677  phosphoglycerate kinase  55.26 
 
 
418 aa  455  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.575292 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  55.87 
 
 
397 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0736  hypothetical protein  52.42 
 
 
401 aa  422  1e-117  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  55.1 
 
 
393 aa  420  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.06 
 
 
650 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.04 
 
 
646 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  53.44 
 
 
397 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  51.78 
 
 
402 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 
402 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  52.67 
 
 
394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  51.52 
 
 
401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  53.81 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  51.78 
 
 
401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 
402 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 
402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  50.89 
 
 
402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  51.27 
 
 
401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 
402 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  52.42 
 
 
394 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  52.16 
 
 
394 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 
389 aa  404  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  52.42 
 
 
394 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  52.93 
 
 
394 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  53.05 
 
 
395 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  51.91 
 
 
394 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  51.78 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  52.16 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  51.91 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  51.91 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  51.26 
 
 
402 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  52.41 
 
 
395 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 
401 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  52.16 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  52.16 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 
403 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  51.91 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  51.78 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  52.31 
 
 
397 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  51.65 
 
 
400 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  50.89 
 
 
394 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  51.15 
 
 
393 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  50.38 
 
 
435 aa  396  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  53.3 
 
 
400 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  51.79 
 
 
393 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  50.89 
 
 
394 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 
401 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  52.26 
 
 
399 aa  392  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 
401 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 
396 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  50.77 
 
 
393 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 
396 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 
397 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 
397 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  50 
 
 
395 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  51.27 
 
 
398 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  50.89 
 
 
395 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  51.15 
 
 
394 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  51.02 
 
 
397 aa  383  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  48.32 
 
 
398 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 
394 aa  380  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  51.79 
 
 
394 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  47.33 
 
 
392 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  47.68 
 
 
399 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  48.61 
 
 
396 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  47.68 
 
 
399 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  49.74 
 
 
441 aa  379  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  50.64 
 
 
397 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  49.36 
 
 
399 aa  381  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 
396 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  48.61 
 
 
396 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  48.6 
 
 
399 aa  375  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  48.36 
 
 
396 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 
398 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  48.2 
 
 
399 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 
406 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 
397 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  50.26 
 
 
397 aa  373  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48983  predicted protein  51.41 
 
 
448 aa  373  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 
396 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.15 
 
 
654 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  47.73 
 
 
399 aa  370  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  46.58 
 
 
443 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1248  phosphoglycerate kinase  46.1 
 
 
400 aa  369  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00549877  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0515  phosphoglycerate kinase  44.84 
 
 
399 aa  366  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18653  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  46.7 
 
 
393 aa  368  1e-100  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  48 
 
 
395 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  50.12 
 
 
407 aa  364  1e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  48.99 
 
 
399 aa  364  1e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  46.06 
 
 
393 aa  364  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  44.81 
 
 
397 aa  363  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  47.03 
 
 
399 aa  363  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  48.5 
 
 
395 aa  362  8e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>