More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1778 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  100 
 
 
394 aa  788    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  74.17 
 
 
394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07140  phosphoglycerate kinase  70.3 
 
 
398 aa  541  1e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.954732  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  63.75 
 
 
396 aa  505  9.999999999999999e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  57.87 
 
 
397 aa  451  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  56.67 
 
 
394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  58.12 
 
 
401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  57.18 
 
 
394 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  58.14 
 
 
402 aa  438  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  59.95 
 
 
400 aa  439  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  57.14 
 
 
397 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  57.33 
 
 
393 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  58.63 
 
 
400 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  57.14 
 
 
397 aa  438  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  56.77 
 
 
402 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  54.45 
 
 
650 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  54.1 
 
 
393 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  57.11 
 
 
401 aa  428  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  56.09 
 
 
401 aa  431  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  58.51 
 
 
393 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  54.06 
 
 
646 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  55.22 
 
 
389 aa  429  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  56.23 
 
 
400 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  57.18 
 
 
394 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  56.23 
 
 
400 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  56.35 
 
 
401 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  54.04 
 
 
402 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  56.01 
 
 
398 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  52.93 
 
 
396 aa  426  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  54.29 
 
 
402 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  54.48 
 
 
394 aa  421  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  54.62 
 
 
394 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  54.43 
 
 
397 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  54.36 
 
 
394 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  56.07 
 
 
401 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  54.29 
 
 
402 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  54.62 
 
 
394 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  54.36 
 
 
394 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  56.33 
 
 
401 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  54.36 
 
 
394 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  54.1 
 
 
394 aa  418  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  53.28 
 
 
402 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  54.1 
 
 
394 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  54.1 
 
 
394 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  54.1 
 
 
394 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  53.45 
 
 
399 aa  419  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  57.5 
 
 
406 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  54.36 
 
 
394 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  58.06 
 
 
394 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  54.36 
 
 
394 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  51.15 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  56.38 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  53.2 
 
 
399 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  55.95 
 
 
400 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  55.38 
 
 
393 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  53.16 
 
 
395 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  56.12 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  52.78 
 
 
397 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  53.3 
 
 
397 aa  414  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  52.42 
 
 
399 aa  413  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  53.59 
 
 
392 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  55.1 
 
 
395 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  52.51 
 
 
407 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  52.64 
 
 
397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4529  Phosphoglycerate kinase  55.5 
 
 
388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0899746  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1398  Phosphoglycerate kinase  52.51 
 
 
398 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  51.65 
 
 
398 aa  402  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  51.92 
 
 
396 aa  401  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  54.01 
 
 
435 aa  398  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  51.14 
 
 
395 aa  398  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  54.5 
 
 
392 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  51.26 
 
 
395 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  54.34 
 
 
396 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  53.59 
 
 
396 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.87 
 
 
655 aa  395  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  54.59 
 
 
396 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2700  phosphoglycerate kinase  51.01 
 
 
396 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  47.96 
 
 
393 aa  397  1e-109  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  53.3 
 
 
396 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  54.34 
 
 
396 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  48.59 
 
 
400 aa  392  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  52.02 
 
 
397 aa  393  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 
399 aa  394  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  50.76 
 
 
397 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  52.74 
 
 
401 aa  393  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  47.45 
 
 
443 aa  388  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  51.52 
 
 
397 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1715  phosphoglycerate kinase  47.48 
 
 
419 aa  388  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  49.36 
 
 
396 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1248  phosphoglycerate kinase  46.98 
 
 
400 aa  385  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00549877  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2123  phosphoglycerate kinase  53.81 
 
 
397 aa  385  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357501  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  49.36 
 
 
396 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0616  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 
399 aa  386  1e-106  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.160418 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  52.53 
 
 
402 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  50.88 
 
 
403 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 
395 aa  385  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15210  phosphoglycerate kinase  51.89 
 
 
400 aa  385  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00329101  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  47.46 
 
 
396 aa  382  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  51.01 
 
 
395 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0515  phosphoglycerate kinase  45.73 
 
 
399 aa  383  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>