More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1800 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 402 aa  808    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  60.15 
 
 		 399 aa  497  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  59.65 
 
 		 399 aa  494  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  59.85 
 
 		 650 aa  484  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  59.2 
 
 		 394 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  59.25 
 
 		 393 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  57.21 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  55.45 
 
 		 400 aa  458  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  56.68 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  55.45 
 
 		 397 aa  455  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  55.56 
 
 		 646 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  57.46 
 
 		 403 aa  455  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  56.54 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  56.44 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  56.19 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  56.22 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  60.55 
 
 		 400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  59.2 
 
 		 395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  59.4 
 
 		 396 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  58.46 
 
 		 394 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  58.19 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  55.97 
 
 		 396 aa  450  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  55.2 
 
 		 655 aa  451  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  56.11 
 
 		 397 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  58.75 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  59.55 
 
 		 392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  58.75 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  55.61 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl577  phosphoglycerate kinase  54.15 
 
 		 404 aa  441  1e-123  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  58.25 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  57.71 
 
 		 392 aa  444  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  55.61 
 
 		 397 aa  444  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  55.11 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  58.5 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  57.64 
 
 		 394 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  58.46 
 
 		 393 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  56.67 
 
 		 400 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  56.47 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  56.67 
 
 		 400 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  56.25 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  55.45 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  53.06 
 
 		 407 aa  433  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  54.98 
 
 		 394 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  57.21 
 
 		 393 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  55.47 
 
 		 394 aa  431  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1418  Phosphoglycerate kinase  54.93 
 
 		 403 aa  431  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0631  phosphoglycerate kinase  52.44 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0347662  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  58.96 
 
 		 393 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  54.48 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  52.87 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  54.98 
 
 		 394 aa  428  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1921  phosphoglycerate kinase  51.71 
 
 		 405 aa  429  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0108168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  54.98 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  56.48 
 
 		 406 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  53.07 
 
 		 399 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  51.61 
 
 		 399 aa  425  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  54.73 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  54.73 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  54.73 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  54.73 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  57.76 
 
 		 389 aa  426  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  54.98 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  56.11 
 
 		 395 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  54.23 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0638  phosphoglycerate kinase  51.1 
 
 		 404 aa  425  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0343575  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  52.38 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  54.08 
 
 		 401 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03315  phosphoglycerate kinase  51.13 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0616  phosphoglycerate kinase  51.61 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.160418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  55.22 
 
 		 400 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  51.75 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2229  phosphoglycerate kinase  50.89 
 
 		 395 aa  411  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2515  phosphoglycerate kinase  56.36 
 
 		 397 aa  413  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  52.27 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  56.68 
 
 		 389 aa  411  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  52.3 
 
 		 401 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2123  phosphoglycerate kinase  55.5 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  52.22 
 
 		 402 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  55.72 
 
 		 394 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  51.85 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  51.98 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  53.06 
 
 		 401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0977  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 		 395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  52.22 
 
 		 402 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  53.69 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  52.04 
 
 		 401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1324  phosphoglycerate kinase  51.51 
 
 		 396 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0186876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  51.11 
 
 		 402 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  52.56 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  51.64 
 
 		 399 aa  403  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1755  phosphoglycerate kinase  50.99 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.542191  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 		 402 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  54.11 
 
 		 399 aa  403  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  55.33 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  55.09 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  50.75 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2700  phosphoglycerate kinase  51.26 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>