More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1134 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
389 aa  778    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  66.08 
 
 
395 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  63.04 
 
 
395 aa  490  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  54.48 
 
 
399 aa  429  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  54.22 
 
 
399 aa  428  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  57.76 
 
 
402 aa  426  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  52.94 
 
 
400 aa  422  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  53.67 
 
 
399 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  58.35 
 
 
393 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  55.22 
 
 
394 aa  415  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  54.45 
 
 
392 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  56.2 
 
 
395 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  51.15 
 
 
397 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  55.44 
 
 
395 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  53.71 
 
 
396 aa  408  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.26 
 
 
646 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  54.78 
 
 
392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4529  Phosphoglycerate kinase  58.57 
 
 
388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0899746  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2700  phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 
396 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  51.92 
 
 
394 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  52.85 
 
 
400 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  54.31 
 
 
395 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  52.72 
 
 
400 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  51.28 
 
 
394 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  52.85 
 
 
400 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  51.66 
 
 
393 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  54.85 
 
 
394 aa  401  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  52.27 
 
 
401 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  52.91 
 
 
402 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 
402 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  51.52 
 
 
401 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  51.26 
 
 
407 aa  397  1e-109  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.89 
 
 
655 aa  396  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07140  phosphoglycerate kinase  53.18 
 
 
398 aa  396  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.954732  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  53.71 
 
 
393 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  53.85 
 
 
393 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  51.41 
 
 
394 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  51.78 
 
 
401 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  50.76 
 
 
401 aa  393  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  52.42 
 
 
394 aa  394  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  50.39 
 
 
396 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  53.08 
 
 
395 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 
401 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 
402 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  50 
 
 
435 aa  389  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 
395 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.36 
 
 
650 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  50 
 
 
402 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  50 
 
 
401 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  50 
 
 
394 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 
394 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 
394 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 
394 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 
394 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 
394 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 
394 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  49.24 
 
 
402 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 
394 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  53.69 
 
 
400 aa  388  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  50.9 
 
 
396 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 
394 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 
394 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  50 
 
 
397 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  50 
 
 
397 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  51.54 
 
 
398 aa  386  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 
394 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  47.24 
 
 
399 aa  385  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 
402 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2064  phosphoglycerate kinase  53.25 
 
 
400 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  52.9 
 
 
406 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  48.21 
 
 
396 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  50.75 
 
 
403 aa  382  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1921  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 
405 aa  382  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0108168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  48.21 
 
 
396 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  49.75 
 
 
441 aa  383  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  52.76 
 
 
397 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  48.61 
 
 
402 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  47.09 
 
 
399 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  51.26 
 
 
399 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  51.89 
 
 
395 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  48.99 
 
 
398 aa  378  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1398  Phosphoglycerate kinase  48.5 
 
 
398 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3009  Phosphoglycerate kinase  52.39 
 
 
394 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0329661 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  49.1 
 
 
397 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0638  phosphoglycerate kinase  48.62 
 
 
404 aa  375  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0343575  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  51.53 
 
 
389 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  48.47 
 
 
394 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15880  phosphoglycerate kinase  51.75 
 
 
402 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00341206  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  48.21 
 
 
396 aa  372  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2539  Phosphoglycerate kinase  51.65 
 
 
412 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  47.46 
 
 
397 aa  374  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1638  phosphoglycerate kinase  53.5 
 
 
400 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  51.78 
 
 
400 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  51.89 
 
 
395 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  47.09 
 
 
399 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2229  phosphoglycerate kinase  47.98 
 
 
395 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1755  phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 
399 aa  372  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.542191  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0515  phosphoglycerate kinase  44.42 
 
 
399 aa  369  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18653  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  47.47 
 
 
397 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0631  phosphoglycerate kinase  48.37 
 
 
404 aa  371  1e-101  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0347662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>