More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2047 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 397 aa  768    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15880  phosphoglycerate kinase  72.5 
 
 		 402 aa  548  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00341206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2801  Phosphoglycerate kinase  66.75 
 
 		 398 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000278767  hitchhiker  0.000011346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3324  phosphoglycerate kinase  69.27 
 
 		 399 aa  508  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2980  Phosphoglycerate kinase  66.33 
 
 		 399 aa  508  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.0361725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3097  phosphoglycerate kinase  69.11 
 
 		 399 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767989  normal  0.141125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3009  Phosphoglycerate kinase  68.34 
 
 		 394 aa  500  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0329661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1638  phosphoglycerate kinase  67.83 
 
 		 400 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3709  phosphoglycerate kinase  65.09 
 
 		 402 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2199  Phosphoglycerate kinase  65 
 
 		 395 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000332645  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5198  Phosphoglycerate kinase  64.25 
 
 		 388 aa  481  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  64.25 
 
 		 395 aa  478  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11360  phosphoglycerate kinase  64.95 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.430751  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2539  Phosphoglycerate kinase  64.29 
 
 		 412 aa  479  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2405  phosphoglycerate kinase  63.37 
 
 		 407 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  63.07 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2451  phosphoglycerate kinase  63.37 
 
 		 407 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2704  phosphoglycerate kinase  63.46 
 
 		 407 aa  478  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2445  phosphoglycerate kinase  63.37 
 
 		 407 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.637803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2364  Phosphoglycerate kinase  64.59 
 
 		 403 aa  471  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2531  phosphoglycerate kinase  68.62 
 
 		 399 aa  474  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  63.24 
 
 		 395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  63.29 
 
 		 395 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1942  Phosphoglycerate kinase  65 
 
 		 395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.797468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2064  phosphoglycerate kinase  65.09 
 
 		 400 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  62.19 
 
 		 398 aa  463  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  63.24 
 
 		 687 aa  463  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1829  phosphoglycerate kinase  60.25 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192854 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  60.85 
 
 		 399 aa  460  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  61.1 
 
 		 399 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2170  Phosphoglycerate kinase  63.77 
 
 		 399 aa  457  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2088  phosphoglycerate kinase  59.11 
 
 		 408 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.283542  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11465  phosphoglycerate kinase  60.5 
 
 		 412 aa  444  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0038039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15210  phosphoglycerate kinase  58.4 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00329101  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  57.67 
 
 		 401 aa  429  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  58.91 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2930  Phosphoglycerate kinase  63.11 
 
 		 412 aa  423  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1549  Phosphoglycerate kinase  61.11 
 
 		 405 aa  403  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  51.67 
 
 		 393 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.87 
 
 		 646 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.4 
 
 		 650 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 		 397 aa  388  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  56.06 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  51.15 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  51.99 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  51.15 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  52.76 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  52.44 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  50.9 
 
 		 395 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  50.12 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  51.93 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  51.16 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 		 394 aa  368  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  48.39 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  51.61 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  47.54 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  51.87 
 
 		 401 aa  366  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  52.44 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  47.5 
 
 		 396 aa  368  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  49.23 
 
 		 394 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  47.45 
 
 		 402 aa  363  3e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 		 397 aa  363  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 		 397 aa  363  4e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  48.51 
 
 		 397 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  51.65 
 
 		 400 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  48.59 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4529  Phosphoglycerate kinase  53.88 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0899746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  51.16 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  50.62 
 
 		 401 aa  360  2e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  46.56 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  50.12 
 
 		 402 aa  361  2e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  51.16 
 
 		 393 aa  358  9e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  46.91 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 396 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  48.38 
 
 		 400 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  48.38 
 
 		 400 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  48.75 
 
 		 394 aa  355  1e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  46.39 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  51.28 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  47.16 
 
 		 396 aa  353  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  47.16 
 
 		 396 aa  353  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.33 
 
 		 655 aa  353  4e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  47.7 
 
 		 398 aa  353  4e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  47.06 
 
 		 399 aa  352  5e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  47.87 
 
 		 403 aa  352  5.9999999999999994e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  50.87 
 
 		 400 aa  352  5.9999999999999994e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 406 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  47.24 
 
 		 435 aa  352  8e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>