More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1638 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1638  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 400 aa  770    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2064  phosphoglycerate kinase  85.25 
 
 		 400 aa  619  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  67.83 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  66.17 
 
 		 395 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2199  Phosphoglycerate kinase  67.91 
 
 		 395 aa  495  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000332645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  66.42 
 
 		 395 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3324  phosphoglycerate kinase  69.4 
 
 		 399 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  67.66 
 
 		 395 aa  491  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3097  phosphoglycerate kinase  68.91 
 
 		 399 aa  488  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767989  normal  0.141125 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  65.52 
 
 		 687 aa  490  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2801  Phosphoglycerate kinase  64.44 
 
 		 398 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000278767  hitchhiker  0.000011346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15880  phosphoglycerate kinase  64.6 
 
 		 402 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00341206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3009  Phosphoglycerate kinase  66.33 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0329661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  63.18 
 
 		 397 aa  471  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5198  Phosphoglycerate kinase  63.21 
 
 		 388 aa  465  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2980  Phosphoglycerate kinase  61.73 
 
 		 399 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.0361725 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  62.22 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2539  Phosphoglycerate kinase  62.38 
 
 		 412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  59.61 
 
 		 399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  60.84 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1942  Phosphoglycerate kinase  63.77 
 
 		 395 aa  443  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.797468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1829  phosphoglycerate kinase  61.19 
 
 		 408 aa  438  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192854 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11360  phosphoglycerate kinase  62.8 
 
 		 415 aa  438  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.430751  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2170  Phosphoglycerate kinase  62.9 
 
 		 399 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15210  phosphoglycerate kinase  58.56 
 
 		 400 aa  436  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00329101  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2704  phosphoglycerate kinase  59.47 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3709  phosphoglycerate kinase  59.8 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2364  Phosphoglycerate kinase  62.07 
 
 		 403 aa  438  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2088  phosphoglycerate kinase  60.95 
 
 		 408 aa  433  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.283542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2445  phosphoglycerate kinase  58.88 
 
 		 407 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.637803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2405  phosphoglycerate kinase  58.88 
 
 		 407 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2531  phosphoglycerate kinase  64.32 
 
 		 399 aa  428  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2451  phosphoglycerate kinase  58.88 
 
 		 407 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11465  phosphoglycerate kinase  58.84 
 
 		 412 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0038039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  57.32 
 
 		 401 aa  410  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2930  Phosphoglycerate kinase  64.34 
 
 		 412 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  56.34 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  53.5 
 
 		 389 aa  392  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1549  Phosphoglycerate kinase  60.88 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  54.66 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  49.38 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  48.76 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  48.51 
 
 		 394 aa  381  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  48.51 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  48.51 
 
 		 394 aa  381  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  51.74 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.25 
 
 		 646 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.26 
 
 		 650 aa  378  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  48.51 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  48.51 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  48.51 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  51.12 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  49.5 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  48.26 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  48.51 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  49 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  51.12 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  48.26 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  53.43 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  50.5 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  51.12 
 
 		 399 aa  376  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  51.98 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  52.51 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  52.51 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  53.16 
 
 		 401 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  48.75 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  51.74 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  49.88 
 
 		 435 aa  368  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  48.76 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  50.62 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  51.49 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  48.51 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  48.76 
 
 		 395 aa  368  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4529  Phosphoglycerate kinase  54.36 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0899746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  51.76 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  51.13 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  48.76 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  51.23 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  52.51 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  48.77 
 
 		 403 aa  363  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  51.51 
 
 		 401 aa  363  3e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  47.63 
 
 		 398 aa  363  3e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  48.75 
 
 		 397 aa  363  4e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  51.63 
 
 		 393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  51.12 
 
 		 395 aa  362  9e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  49.25 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07140  phosphoglycerate kinase  50.37 
 
 		 398 aa  360  2e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.954732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  47.89 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1428  phosphoglycerate kinase  47.89 
 
 		 401 aa  360  3e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 401 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0515  phosphoglycerate kinase  47.51 
 
 		 399 aa  358  7e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18653  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  49.25 
 
 		 389 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  46.65 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  48.16 
 
 		 402 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  48.26 
 
 		 399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 401 aa  356  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  47.91 
 
 		 402 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.15 
 
 		 655 aa  356  5e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>