More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3335 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 397 aa  801    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2700  phosphoglycerate kinase  69.7 
 
 		 396 aa  558  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  67.34 
 
 		 395 aa  549  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2229  phosphoglycerate kinase  69.37 
 
 		 395 aa  537  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1398  Phosphoglycerate kinase  67.25 
 
 		 398 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1324  phosphoglycerate kinase  60.45 
 
 		 396 aa  492  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0186876  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0977  phosphoglycerate kinase  59.95 
 
 		 395 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1677  phosphoglycerate kinase  57.76 
 
 		 418 aa  474  1e-132  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.575292 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03315  phosphoglycerate kinase  56.93 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0736  hypothetical protein  55.56 
 
 		 401 aa  435  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  54.55 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  55.3 
 
 		 393 aa  420  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.03 
 
 		 650 aa  412  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  52.5 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  53.03 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  52.53 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  52.53 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  52.27 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  52.27 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  52.53 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  52.74 
 
 		 403 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  52.27 
 
 		 394 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.01 
 
 		 646 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  51.77 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  52.02 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  52.02 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  52.02 
 
 		 394 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  52.02 
 
 		 394 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  52.27 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  51.64 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  52.01 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  52.14 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  51.39 
 
 		 399 aa  393  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  51.9 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  51.25 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  51.01 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  48.87 
 
 		 443 aa  388  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  50.91 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  51.76 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 402 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  50.76 
 
 		 401 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  49.12 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  49.12 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  50.5 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  49.49 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 		 401 aa  383  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  50.52 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  48.61 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  49.25 
 
 		 399 aa  378  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  49.24 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  50.75 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  52.41 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 		 396 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  50.75 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 393 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  51.3 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  48.49 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0515  phosphoglycerate kinase  47.21 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18653  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1248  phosphoglycerate kinase  47.59 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00549877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.1 
 
 		 654 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  48.49 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  47.47 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  52.64 
 
 		 400 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  48.45 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  50.78 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  50.78 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 394 aa  371  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  47.36 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  49.12 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  47.61 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  47.47 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07140  phosphoglycerate kinase  49.24 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.954732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  46.21 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1428  phosphoglycerate kinase  46.84 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  47.58 
 
 		 393 aa  368  1e-100  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.62 
 
 		 655 aa  365  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0778  phosphoglycerate kinase  47.15 
 
 		 405 aa  368  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000119701  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  47.1 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  49.5 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1715  phosphoglycerate kinase  47.03 
 
 		 419 aa  363  3e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01246  Phosphoglycerate kinase (EC 2.7.2.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P11977]  49.64 
 
 		 421 aa  362  7.0000000000000005e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02220  phosphoglycerate kinase, putative  48.66 
 
 		 454 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  47.61 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  49.12 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  48.96 
 
 		 401 aa  359  6e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  48.62 
 
 		 406 aa  358  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>