More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2060 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 397 aa  804    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  51.91 
 
 		 398 aa  420  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  51.69 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  51.4 
 
 		 399 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  51.4 
 
 		 399 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0677  phosphoglycerate kinase  52.17 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  50.76 
 
 		 399 aa  414  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.59 
 
 		 654 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  51.79 
 
 		 402 aa  411  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 		 401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  51.15 
 
 		 394 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  52.28 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  52.54 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  52.28 
 
 		 396 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  51.56 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  48.73 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0879  Phosphoglycerate kinase  51.41 
 
 		 393 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.436803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  51.15 
 
 		 393 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  49.11 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  50.77 
 
 		 400 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  50.37 
 
 		 406 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  50.77 
 
 		 400 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  51.4 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 395 aa  398  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  50.26 
 
 		 396 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  48.86 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  47.94 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 		 396 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  50.26 
 
 		 395 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1617  phosphoglycerate kinase  50.78 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0893272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1551  Phosphoglycerate kinase  48.34 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 		 443 aa  395  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 397 aa  398  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  47.97 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  49.48 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  50.39 
 
 		 401 aa  393  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  47.98 
 
 		 402 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  50.9 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  49.36 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  49.61 
 
 		 401 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.87 
 
 		 650 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  47.72 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  47.46 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  48.1 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  47.96 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 		 397 aa  388  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  48.11 
 
 		 402 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  47.96 
 
 		 399 aa  386  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  48.11 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 		 397 aa  385  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 		 394 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  51.28 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  49.36 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1324  phosphoglycerate kinase  47.86 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0186876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  47.36 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03315  phosphoglycerate kinase  46.58 
 
 		 420 aa  376  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  49.25 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2123  phosphoglycerate kinase  49.23 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  47.7 
 
 		 393 aa  378  1e-103  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  50.77 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  50.52 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  47.34 
 
 		 398 aa  373  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1430  Phosphoglycerate kinase  47.31 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.96706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  47.96 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  50.26 
 
 		 393 aa  375  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  46.53 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2515  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  47.36 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.5 
 
 		 646 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3269  Phosphoglycerate kinase  48.11 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.891729  decreased coverage  0.00998041 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  47.7 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  47.45 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  47.45 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  47.7 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  50.52 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  46.85 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  47.7 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  49.12 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  47.45 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  46.29 
 
 		 395 aa  371  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  47.96 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  48.33 
 
 		 400 aa  371  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  47.45 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  47.19 
 
 		 394 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  48.47 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  47.19 
 
 		 394 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0977  phosphoglycerate kinase  47.46 
 
 		 395 aa  365  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  49.23 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2229  phosphoglycerate kinase  47.09 
 
 		 395 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  47.21 
 
 		 395 aa  363  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2700  phosphoglycerate kinase  44.81 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>