More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2060 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  85.82 
 
 		 654 aa  699    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  86.68 
 
 		 399 aa  724    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  86.72 
 
 		 399 aa  728    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  86.15 
 
 		 398 aa  715    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 399 aa  820    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1617  phosphoglycerate kinase  72.84 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0893272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  69.54 
 
 		 399 aa  591  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  56.23 
 
 		 399 aa  458  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  57.11 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  53.4 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1753  phosphoglycerate kinase  56.88 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.093261  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  55.44 
 
 		 394 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1248  phosphoglycerate kinase  55.58 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00549877  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0416  phosphoglycerate kinase  55.58 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1428  phosphoglycerate kinase  55.79 
 
 		 401 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0677  phosphoglycerate kinase  56.74 
 
 		 396 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0778  phosphoglycerate kinase  54.45 
 
 		 405 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000119701  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0515  phosphoglycerate kinase  54.81 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18653  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1551  Phosphoglycerate kinase  54.08 
 
 		 392 aa  435  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  52.38 
 
 		 402 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  52.75 
 
 		 402 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  53 
 
 		 401 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  53 
 
 		 401 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  54.92 
 
 		 394 aa  428  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  52.13 
 
 		 402 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  51.88 
 
 		 402 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  53 
 
 		 401 aa  428  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  53.11 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  51.5 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  55.38 
 
 		 395 aa  423  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  52.44 
 
 		 401 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  55.1 
 
 		 403 aa  424  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  54.1 
 
 		 399 aa  422  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  54.38 
 
 		 398 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  52.27 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  53.5 
 
 		 399 aa  422  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  52.78 
 
 		 393 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1589  phosphoglycerate kinase  55.06 
 
 		 400 aa  420  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  53.63 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1736  phosphoglycerate kinase  55.32 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  52.07 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  55.01 
 
 		 650 aa  420  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  51.69 
 
 		 393 aa  418  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  51.69 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1401  phosphoglycerate kinase  54.92 
 
 		 400 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  52.96 
 
 		 400 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  52.96 
 
 		 400 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  53.61 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  53.79 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  53.5 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  51.25 
 
 		 402 aa  413  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  51.64 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  53.3 
 
 		 402 aa  412  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  52.91 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0739  phosphoglycerate kinase  52.73 
 
 		 395 aa  408  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000102804  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  51.94 
 
 		 401 aa  408  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  51.13 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  51.77 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  51.76 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  51.13 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  52.35 
 
 		 406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  52.6 
 
 		 397 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  52.85 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0879  Phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.436803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  52.07 
 
 		 392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  52.22 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  52.73 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  51.81 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  50.9 
 
 		 397 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  51.66 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.89 
 
 		 646 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  52.45 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  51.16 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 		 394 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 		 394 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  50.26 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  52.96 
 
 		 400 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  49.11 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 		 393 aa  393  1e-108  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  49.11 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  49.11 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  50.77 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 394 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  49.48 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  50.78 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  49.12 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2657  phosphoglycerate kinase  48.73 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  49.61 
 
 		 398 aa  383  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1418  Phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2628  phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0037  phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0995  phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0833  phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0838  phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0591  phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>