More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0879 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0879  Phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 393 aa  793    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.436803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1551  Phosphoglycerate kinase  64.19 
 
 		 392 aa  509  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  52.55 
 
 		 398 aa  420  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  52.04 
 
 		 393 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.07 
 
 		 654 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 399 aa  408  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  51.15 
 
 		 392 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  51.79 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  51.51 
 
 		 403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  53.98 
 
 		 393 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  51.67 
 
 		 395 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  51.41 
 
 		 397 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1617  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 397 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0893272  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  50.9 
 
 		 394 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0677  phosphoglycerate kinase  51.27 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  48.73 
 
 		 399 aa  391  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  50.9 
 
 		 394 aa  388  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 397 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  47.45 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  47.19 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  47.45 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.09 
 
 		 646 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  46.94 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  48.99 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  47.19 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  47.58 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  48.21 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  47.19 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  47.19 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  47.19 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  47.19 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  47.94 
 
 		 393 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.37 
 
 		 650 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  47.19 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  48.21 
 
 		 399 aa  381  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  48.58 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  48.73 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  48.73 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  48.21 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2123  phosphoglycerate kinase  51.53 
 
 		 397 aa  378  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  46.94 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  47.46 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  48.22 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  47.33 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  48.36 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  47.16 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1753  phosphoglycerate kinase  48.21 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.093261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  47.58 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 		 402 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1248  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00549877  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  44.64 
 
 		 394 aa  368  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0739  phosphoglycerate kinase  47.96 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000102804  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  48.6 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  48.35 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  47.07 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1418  Phosphoglycerate kinase  47.85 
 
 		 403 aa  368  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2021  phosphoglycerate kinase  48.85 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  47.72 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  48.47 
 
 		 401 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0416  phosphoglycerate kinase  47.19 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  48.11 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  48.1 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  49.61 
 
 		 401 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0515  phosphoglycerate kinase  47.96 
 
 		 399 aa  364  2e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18653  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0744  phosphoglycerate kinase  47.44 
 
 		 397 aa  363  3e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  47.7 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  49.36 
 
 		 401 aa  363  4e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  48.87 
 
 		 401 aa  360  2e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  48.21 
 
 		 401 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0778  phosphoglycerate kinase  48.19 
 
 		 405 aa  360  2e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000119701  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  45.95 
 
 		 393 aa  361  2e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  45.45 
 
 		 398 aa  360  3e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  46.29 
 
 		 403 aa  360  3e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  46.82 
 
 		 441 aa  359  4e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  48.23 
 
 		 395 aa  359  6e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 		 401 aa  357  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2515  phosphoglycerate kinase  49.24 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  47.7 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  49.1 
 
 		 392 aa  358  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  46.8 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  48.61 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  45.84 
 
 		 397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  49.48 
 
 		 396 aa  357  2.9999999999999997e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.8 
 
 		 655 aa  355  5e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  44.78 
 
 		 393 aa  355  7.999999999999999e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  43.4 
 
 		 400 aa  355  8.999999999999999e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  46.31 
 
 		 402 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>