More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2016 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 395 aa  776    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3009  Phosphoglycerate kinase  82.49 
 
 		 394 aa  626  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0329661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2199  Phosphoglycerate kinase  80.51 
 
 		 395 aa  619  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000332645  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  74.94 
 
 		 395 aa  586  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  73.1 
 
 		 395 aa  569  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  71.9 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  69.46 
 
 		 687 aa  533  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5198  Phosphoglycerate kinase  69.1 
 
 		 388 aa  528  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2980  Phosphoglycerate kinase  66.75 
 
 		 399 aa  521  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.0361725 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  66.75 
 
 		 398 aa  520  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15210  phosphoglycerate kinase  65.91 
 
 		 400 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00329101  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  65.58 
 
 		 399 aa  511  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1942  Phosphoglycerate kinase  67.93 
 
 		 395 aa  505  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.797468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2170  Phosphoglycerate kinase  66.92 
 
 		 399 aa  502  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1638  phosphoglycerate kinase  67.66 
 
 		 400 aa  495  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  64.32 
 
 		 399 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  64.25 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3097  phosphoglycerate kinase  66.17 
 
 		 399 aa  485  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767989  normal  0.141125 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2531  phosphoglycerate kinase  68.29 
 
 		 399 aa  485  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  63.09 
 
 		 401 aa  486  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3324  phosphoglycerate kinase  66.5 
 
 		 399 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11360  phosphoglycerate kinase  62.72 
 
 		 415 aa  478  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.430751  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15880  phosphoglycerate kinase  62.59 
 
 		 402 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00341206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  61.35 
 
 		 401 aa  474  1e-132  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2930  Phosphoglycerate kinase  67.15 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1829  phosphoglycerate kinase  61.68 
 
 		 408 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2064  phosphoglycerate kinase  65.42 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2801  Phosphoglycerate kinase  61.35 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000278767  hitchhiker  0.000011346 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2088  phosphoglycerate kinase  60.91 
 
 		 408 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.283542  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2539  Phosphoglycerate kinase  61.03 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1549  Phosphoglycerate kinase  63.52 
 
 		 405 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3709  phosphoglycerate kinase  57.57 
 
 		 402 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  52.91 
 
 		 393 aa  425  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2405  phosphoglycerate kinase  57.49 
 
 		 407 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2445  phosphoglycerate kinase  57.49 
 
 		 407 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.637803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2451  phosphoglycerate kinase  57.49 
 
 		 407 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2704  phosphoglycerate kinase  56.13 
 
 		 407 aa  423  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2364  Phosphoglycerate kinase  59.7 
 
 		 403 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11465  phosphoglycerate kinase  57.76 
 
 		 412 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0038039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  54.43 
 
 		 399 aa  410  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  52.81 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  54.68 
 
 		 399 aa  410  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  53.3 
 
 		 395 aa  408  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.14 
 
 		 650 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  53.3 
 
 		 393 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  51.88 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  52.91 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.4 
 
 		 646 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  51.14 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  51.65 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  50.89 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  53.06 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  52.02 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  53.06 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  50.88 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  50.88 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  52.66 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  51.9 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 394 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 394 aa  388  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4529  Phosphoglycerate kinase  53.69 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0899746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.87 
 
 		 655 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  49.11 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  49.11 
 
 		 394 aa  388  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  51.52 
 
 		 397 aa  386  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  49.11 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  51.26 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  51.76 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  51.99 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 		 402 aa  384  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  51.14 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  50.12 
 
 		 402 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  51.01 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  50.62 
 
 		 403 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  52.56 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  51.25 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  50.12 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  51.88 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  50.89 
 
 		 402 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  51.78 
 
 		 392 aa  381  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  52.16 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  51.63 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  53.3 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  49.63 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  53.42 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  51.24 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  51.38 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  50.75 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  49.63 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>