More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2088 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1829  phosphoglycerate kinase  89.46 
 
 		 408 aa  723    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2088  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 408 aa  805    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.283542  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11360  phosphoglycerate kinase  67.73 
 
 		 415 aa  549  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.430751  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  64.2 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2980  Phosphoglycerate kinase  63.46 
 
 		 399 aa  491  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.0361725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2801  Phosphoglycerate kinase  62.47 
 
 		 398 aa  480  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000278767  hitchhiker  0.000011346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15880  phosphoglycerate kinase  61.33 
 
 		 402 aa  478  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00341206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  63.48 
 
 		 399 aa  472  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  62.44 
 
 		 395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2531  phosphoglycerate kinase  64.72 
 
 		 399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2170  Phosphoglycerate kinase  64.74 
 
 		 399 aa  468  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  63.22 
 
 		 399 aa  468  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2199  Phosphoglycerate kinase  63.2 
 
 		 395 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000332645  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5198  Phosphoglycerate kinase  61.23 
 
 		 388 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3709  phosphoglycerate kinase  60.49 
 
 		 402 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1942  Phosphoglycerate kinase  63.2 
 
 		 395 aa  462  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.797468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2539  Phosphoglycerate kinase  61.69 
 
 		 412 aa  460  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15210  phosphoglycerate kinase  58.87 
 
 		 400 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00329101  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  59.85 
 
 		 398 aa  455  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2364  Phosphoglycerate kinase  62.29 
 
 		 403 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3009  Phosphoglycerate kinase  62.09 
 
 		 394 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0329661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2445  phosphoglycerate kinase  59.18 
 
 		 407 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.637803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  60.41 
 
 		 395 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2405  phosphoglycerate kinase  59.18 
 
 		 407 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  59.11 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2451  phosphoglycerate kinase  59.18 
 
 		 407 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  60.91 
 
 		 395 aa  442  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2704  phosphoglycerate kinase  59.04 
 
 		 407 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3097  phosphoglycerate kinase  59.17 
 
 		 399 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767989  normal  0.141125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3324  phosphoglycerate kinase  59.66 
 
 		 399 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2930  Phosphoglycerate kinase  62.9 
 
 		 412 aa  431  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  57.32 
 
 		 687 aa  428  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11465  phosphoglycerate kinase  56.07 
 
 		 412 aa  420  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0038039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1638  phosphoglycerate kinase  60.95 
 
 		 400 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  56.5 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1549  Phosphoglycerate kinase  59.47 
 
 		 405 aa  401  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  55.25 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2064  phosphoglycerate kinase  58.71 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.51 
 
 		 646 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  48.86 
 
 		 393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  46.8 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 		 395 aa  355  8.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  48.85 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  48.3 
 
 		 402 aa  352  7e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  48.37 
 
 		 399 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  49.51 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  48.37 
 
 		 399 aa  351  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  47.58 
 
 		 393 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  46.08 
 
 		 394 aa  342  8e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  46.12 
 
 		 400 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  43.98 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  46.12 
 
 		 400 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.73 
 
 		 650 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  45.09 
 
 		 397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  47.59 
 
 		 395 aa  339  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  47.34 
 
 		 394 aa  339  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07140  phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 		 398 aa  340  4e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.954732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  47.94 
 
 		 401 aa  339  5e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  45.06 
 
 		 395 aa  339  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  47.7 
 
 		 401 aa  339  5e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  45.09 
 
 		 397 aa  339  5e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.19 
 
 		 655 aa  338  7e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  46.56 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  46.95 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  46.7 
 
 		 395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  45.63 
 
 		 397 aa  335  7e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  47.12 
 
 		 398 aa  335  7e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  45.94 
 
 		 394 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  47.91 
 
 		 389 aa  335  1e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  45.52 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  47.34 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  45.28 
 
 		 402 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  44.81 
 
 		 394 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  44.81 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  44.81 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  44.81 
 
 		 394 aa  333  5e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  44.56 
 
 		 394 aa  332  6e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  47.37 
 
 		 397 aa  332  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  44.56 
 
 		 394 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  46.12 
 
 		 401 aa  332  7.000000000000001e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  46.48 
 
 		 400 aa  332  7.000000000000001e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  44.56 
 
 		 394 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  44.56 
 
 		 394 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  45.73 
 
 		 399 aa  332  9e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  47.12 
 
 		 397 aa  332  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  44.3 
 
 		 394 aa  331  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  44.3 
 
 		 394 aa  331  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  45.1 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  44.3 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  45.86 
 
 		 400 aa  330  4e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  45.94 
 
 		 396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  45.28 
 
 		 401 aa  329  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  46.37 
 
 		 397 aa  329  6e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  46.84 
 
 		 392 aa  328  7e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  45.04 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  44.67 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  45.61 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  43.4 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>