More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2170 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2170  Phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 399 aa  772    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  76.13 
 
 		 399 aa  594  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  76.63 
 
 		 399 aa  596  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1942  Phosphoglycerate kinase  75.94 
 
 		 395 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.797468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2199  Phosphoglycerate kinase  74.19 
 
 		 395 aa  551  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000332645  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  70.07 
 
 		 401 aa  534  1e-150  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  67.76 
 
 		 398 aa  528  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  69.33 
 
 		 401 aa  527  1e-148  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  68.17 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15210  phosphoglycerate kinase  66.92 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00329101  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  67.42 
 
 		 395 aa  521  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3009  Phosphoglycerate kinase  69.1 
 
 		 394 aa  511  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0329661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  66.75 
 
 		 395 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2980  Phosphoglycerate kinase  66 
 
 		 399 aa  511  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.0361725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5198  Phosphoglycerate kinase  67.08 
 
 		 388 aa  508  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2539  Phosphoglycerate kinase  67.15 
 
 		 412 aa  504  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1549  Phosphoglycerate kinase  72.21 
 
 		 405 aa  505  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11360  phosphoglycerate kinase  65.93 
 
 		 415 aa  502  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.430751  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  66.92 
 
 		 395 aa  502  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3709  phosphoglycerate kinase  66.75 
 
 		 402 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2531  phosphoglycerate kinase  68.91 
 
 		 399 aa  501  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2364  Phosphoglycerate kinase  68.7 
 
 		 403 aa  492  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2704  phosphoglycerate kinase  65.44 
 
 		 407 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15880  phosphoglycerate kinase  65.35 
 
 		 402 aa  485  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00341206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1829  phosphoglycerate kinase  64.23 
 
 		 408 aa  488  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2801  Phosphoglycerate kinase  65.1 
 
 		 398 aa  481  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000278767  hitchhiker  0.000011346 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2088  phosphoglycerate kinase  64.74 
 
 		 408 aa  480  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.283542  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2405  phosphoglycerate kinase  63.64 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2451  phosphoglycerate kinase  63.64 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2445  phosphoglycerate kinase  63.64 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.637803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  63.77 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3324  phosphoglycerate kinase  65.01 
 
 		 399 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  61.46 
 
 		 687 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3097  phosphoglycerate kinase  64.18 
 
 		 399 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767989  normal  0.141125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2930  Phosphoglycerate kinase  64.73 
 
 		 412 aa  445  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11465  phosphoglycerate kinase  61.54 
 
 		 412 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0038039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1638  phosphoglycerate kinase  62.9 
 
 		 400 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2064  phosphoglycerate kinase  59.85 
 
 		 400 aa  421  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  52.13 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  54.02 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.75 
 
 		 650 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  51.76 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  54.02 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  54.23 
 
 		 402 aa  403  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  52.94 
 
 		 395 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  54.02 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  50.75 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 		 397 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  54.41 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  51.26 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  51.01 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  51.01 
 
 		 394 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  51.01 
 
 		 394 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 397 aa  392  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  51.01 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  51.26 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  52.44 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  51.26 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  52.44 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  52.26 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.88 
 
 		 646 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  52.12 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  53 
 
 		 395 aa  388  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  50.75 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  51.01 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  50.75 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  53.69 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  51.37 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  51.62 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  51.37 
 
 		 397 aa  388  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  51.01 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  50.75 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  51.28 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  51.51 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.5 
 
 		 655 aa  383  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  51.61 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  51.25 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  53.05 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  52.16 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  52.87 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  51.13 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  51 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  49.12 
 
 		 394 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  51.74 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  49.25 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  49.5 
 
 		 401 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  51.51 
 
 		 402 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  52.49 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  49.5 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  51.76 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  49 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  52.38 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  52.04 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>