More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1549 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1549  Phosphoglycerate kinase  100 
 
 
405 aa  788    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  72.82 
 
 
399 aa  561  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  72.46 
 
 
399 aa  551  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1942  Phosphoglycerate kinase  73.95 
 
 
395 aa  535  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.797468  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2170  Phosphoglycerate kinase  72.21 
 
 
399 aa  533  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  67.57 
 
 
401 aa  513  1e-144  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  67.08 
 
 
401 aa  510  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  65.6 
 
 
397 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15210  phosphoglycerate kinase  63.46 
 
 
400 aa  488  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00329101  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2199  Phosphoglycerate kinase  66.5 
 
 
395 aa  490  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000332645  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5198  Phosphoglycerate kinase  64.22 
 
 
388 aa  480  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  64.56 
 
 
395 aa  474  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3009  Phosphoglycerate kinase  64.68 
 
 
394 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0329661 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  63.77 
 
 
395 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  63.25 
 
 
395 aa  464  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  60.89 
 
 
398 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2531  phosphoglycerate kinase  67.83 
 
 
399 aa  464  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2539  Phosphoglycerate kinase  62.89 
 
 
412 aa  460  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2980  Phosphoglycerate kinase  59.36 
 
 
399 aa  455  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.0361725 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11360  phosphoglycerate kinase  60 
 
 
415 aa  448  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.430751  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2801  Phosphoglycerate kinase  62.01 
 
 
398 aa  444  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000278767  hitchhiker  0.000011346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3709  phosphoglycerate kinase  62.35 
 
 
402 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2704  phosphoglycerate kinase  61.99 
 
 
407 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2364  Phosphoglycerate kinase  62.68 
 
 
403 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15880  phosphoglycerate kinase  60 
 
 
402 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00341206  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  61.11 
 
 
397 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1829  phosphoglycerate kinase  60.55 
 
 
408 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2088  phosphoglycerate kinase  60.44 
 
 
408 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.283542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2445  phosphoglycerate kinase  60.9 
 
 
407 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.637803  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2405  phosphoglycerate kinase  60.9 
 
 
407 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2451  phosphoglycerate kinase  60.9 
 
 
407 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11465  phosphoglycerate kinase  58.74 
 
 
412 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0038039  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  58.11 
 
 
687 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3324  phosphoglycerate kinase  61.27 
 
 
399 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3097  phosphoglycerate kinase  61.95 
 
 
399 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767989  normal  0.141125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2930  Phosphoglycerate kinase  63.01 
 
 
412 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1638  phosphoglycerate kinase  60.88 
 
 
400 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  55.75 
 
 
399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  55.75 
 
 
399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  51.85 
 
 
396 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  52.53 
 
 
394 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  52.27 
 
 
394 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  52.27 
 
 
394 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  52.27 
 
 
394 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  52.27 
 
 
394 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  52.53 
 
 
394 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  52.27 
 
 
394 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  53 
 
 
400 aa  392  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.22 
 
 
650 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  52.53 
 
 
394 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  52.27 
 
 
394 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  52.48 
 
 
397 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  52.53 
 
 
394 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  51.77 
 
 
394 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.1 
 
 
646 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  52.1 
 
 
393 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  53.58 
 
 
400 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  54.18 
 
 
396 aa  385  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2064  phosphoglycerate kinase  58.44 
 
 
400 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  52.96 
 
 
401 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  51.71 
 
 
407 aa  380  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  53.69 
 
 
394 aa  375  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  52.97 
 
 
389 aa  375  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  52.48 
 
 
395 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  52.99 
 
 
394 aa  372  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  52.45 
 
 
402 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  52.48 
 
 
395 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.64 
 
 
655 aa  374  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 
394 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  53.65 
 
 
401 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  51.11 
 
 
400 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  51.11 
 
 
400 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  50.74 
 
 
397 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  50.74 
 
 
397 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  52.53 
 
 
392 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  50.98 
 
 
399 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07140  phosphoglycerate kinase  50.99 
 
 
398 aa  365  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.954732  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  51.48 
 
 
401 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  51.26 
 
 
393 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  51.52 
 
 
393 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  50.62 
 
 
394 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  50.89 
 
 
395 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  50.9 
 
 
402 aa  368  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  53.2 
 
 
400 aa  365  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  50.74 
 
 
401 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  53.45 
 
 
400 aa  365  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  50.87 
 
 
397 aa  364  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  53.41 
 
 
406 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  50.74 
 
 
401 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  49 
 
 
397 aa  359  4e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  50.86 
 
 
401 aa  359  5e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  51.72 
 
 
398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  50.37 
 
 
402 aa  355  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 
393 aa  352  8e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 
398 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  51.76 
 
 
396 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  48.27 
 
 
403 aa  350  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  50.12 
 
 
395 aa  350  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  50.12 
 
 
395 aa  350  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1921  phosphoglycerate kinase  48.64 
 
 
405 aa  348  1e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0108168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>