More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2364 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2364  Phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 403 aa  792    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2539  Phosphoglycerate kinase  80.3 
 
 		 412 aa  633  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3709  phosphoglycerate kinase  78.61 
 
 		 402 aa  627  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2704  phosphoglycerate kinase  77.89 
 
 		 407 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2445  phosphoglycerate kinase  76.41 
 
 		 407 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.637803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2405  phosphoglycerate kinase  76.41 
 
 		 407 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2451  phosphoglycerate kinase  76.41 
 
 		 407 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11465  phosphoglycerate kinase  72.03 
 
 		 412 aa  569  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0038039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15880  phosphoglycerate kinase  68.73 
 
 		 402 aa  531  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00341206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2801  Phosphoglycerate kinase  68.67 
 
 		 398 aa  525  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000278767  hitchhiker  0.000011346 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  68.11 
 
 		 399 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5198  Phosphoglycerate kinase  66.34 
 
 		 388 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2170  Phosphoglycerate kinase  68.7 
 
 		 399 aa  491  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  64.59 
 
 		 397 aa  484  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11360  phosphoglycerate kinase  61.61 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.430751  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  64.11 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1829  phosphoglycerate kinase  61.56 
 
 		 408 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2980  Phosphoglycerate kinase  62.94 
 
 		 399 aa  472  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.0361725 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2088  phosphoglycerate kinase  62.29 
 
 		 408 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.283542  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3324  phosphoglycerate kinase  65.19 
 
 		 399 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  61.5 
 
 		 395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  61.13 
 
 		 398 aa  451  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3097  phosphoglycerate kinase  63.7 
 
 		 399 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767989  normal  0.141125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2199  Phosphoglycerate kinase  63.1 
 
 		 395 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000332645  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  61.93 
 
 		 395 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1638  phosphoglycerate kinase  62.72 
 
 		 400 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1942  Phosphoglycerate kinase  62.85 
 
 		 395 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.797468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  61.39 
 
 		 401 aa  438  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2531  phosphoglycerate kinase  62.63 
 
 		 399 aa  431  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  59.16 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2064  phosphoglycerate kinase  59.85 
 
 		 400 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  59.41 
 
 		 401 aa  426  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3009  Phosphoglycerate kinase  59.95 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0329661 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  59.7 
 
 		 395 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15210  phosphoglycerate kinase  57 
 
 		 400 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00329101  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1549  Phosphoglycerate kinase  62.93 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  57.86 
 
 		 687 aa  412  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  52.31 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  49.63 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  52.45 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  52.26 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.14 
 
 		 646 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  52.01 
 
 		 399 aa  375  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2930  Phosphoglycerate kinase  57.42 
 
 		 412 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 		 401 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  49.39 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  49.39 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.5 
 
 		 650 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  48.89 
 
 		 402 aa  358  7e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  48.27 
 
 		 393 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  49.26 
 
 		 401 aa  357  2.9999999999999997e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 		 402 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  47.46 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  49.39 
 
 		 401 aa  354  2e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  49.51 
 
 		 392 aa  353  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  48.52 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  47.97 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  48.89 
 
 		 401 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  50.37 
 
 		 395 aa  351  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  47.67 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  46.57 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  48.24 
 
 		 402 aa  350  2e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  48.41 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  48.59 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  51.66 
 
 		 394 aa  349  5e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  48.4 
 
 		 399 aa  349  6e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  50.52 
 
 		 392 aa  348  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  49.24 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  50.61 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  49.38 
 
 		 395 aa  347  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  48.65 
 
 		 395 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  48.99 
 
 		 397 aa  346  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  48.89 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  47.55 
 
 		 401 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1428  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 401 aa  346  5e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  47.3 
 
 		 401 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  47.79 
 
 		 395 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.99 
 
 		 655 aa  343  2.9999999999999997e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  48.76 
 
 		 393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  48.04 
 
 		 395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  50.12 
 
 		 406 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  46.4 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07140  phosphoglycerate kinase  49.38 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.954732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  47.8 
 
 		 399 aa  342  1e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  47.28 
 
 		 441 aa  340  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  47.77 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  45.8 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  48.08 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  48.08 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  45.8 
 
 		 394 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  47.43 
 
 		 402 aa  339  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  49.36 
 
 		 393 aa  338  8e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  47.43 
 
 		 402 aa  338  9e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0515  phosphoglycerate kinase  48.23 
 
 		 399 aa  338  9e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18653  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4529  Phosphoglycerate kinase  49.1 
 
 		 388 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0899746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  48.59 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  47.39 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  45.55 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 400 aa  337  2.9999999999999997e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>