More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2704 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2445  phosphoglycerate kinase  83.41 
 
 		 407 aa  678    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.637803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3709  phosphoglycerate kinase  92.14 
 
 		 402 aa  732    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2405  phosphoglycerate kinase  83.41 
 
 		 407 aa  678    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2451  phosphoglycerate kinase  83.41 
 
 		 407 aa  678    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2704  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 407 aa  799    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11465  phosphoglycerate kinase  77.34 
 
 		 412 aa  619  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0038039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2539  Phosphoglycerate kinase  76.11 
 
 		 412 aa  609  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2364  Phosphoglycerate kinase  77.89 
 
 		 403 aa  597  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15880  phosphoglycerate kinase  66.75 
 
 		 402 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00341206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2980  Phosphoglycerate kinase  62.75 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.0361725 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  63.46 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2170  Phosphoglycerate kinase  65.44 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  66.16 
 
 		 399 aa  474  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2801  Phosphoglycerate kinase  62.72 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000278767  hitchhiker  0.000011346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5198  Phosphoglycerate kinase  61.52 
 
 		 388 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11360  phosphoglycerate kinase  60.39 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.430751  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  62.99 
 
 		 399 aa  460  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3324  phosphoglycerate kinase  63.73 
 
 		 399 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3097  phosphoglycerate kinase  63.24 
 
 		 399 aa  448  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767989  normal  0.141125 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  58.97 
 
 		 398 aa  449  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  59.75 
 
 		 395 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  59.27 
 
 		 395 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  59.85 
 
 		 401 aa  443  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2088  phosphoglycerate kinase  59.04 
 
 		 408 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.283542  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1829  phosphoglycerate kinase  57.59 
 
 		 408 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  59.07 
 
 		 397 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  58.15 
 
 		 401 aa  428  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2199  Phosphoglycerate kinase  59.8 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000332645  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1942  Phosphoglycerate kinase  61.52 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.797468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3009  Phosphoglycerate kinase  58.09 
 
 		 394 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0329661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1638  phosphoglycerate kinase  59.47 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2531  phosphoglycerate kinase  60.75 
 
 		 399 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15210  phosphoglycerate kinase  55.64 
 
 		 400 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00329101  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  56.13 
 
 		 395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1549  Phosphoglycerate kinase  60.34 
 
 		 405 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2064  phosphoglycerate kinase  56.8 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  56.39 
 
 		 687 aa  402  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2930  Phosphoglycerate kinase  57.01 
 
 		 412 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  51.6 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  48.17 
 
 		 397 aa  365  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  51.35 
 
 		 399 aa  363  3e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  47.47 
 
 		 393 aa  363  3e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.87 
 
 		 650 aa  363  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.94 
 
 		 646 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  49.15 
 
 		 402 aa  362  6e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  48.4 
 
 		 402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  47.45 
 
 		 395 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  49.63 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  46.1 
 
 		 396 aa  344  1e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 		 400 aa  344  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  44.77 
 
 		 397 aa  344  1e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  46.59 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  49.01 
 
 		 392 aa  343  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  46.23 
 
 		 401 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  48.08 
 
 		 406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  45.5 
 
 		 402 aa  339  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  47.93 
 
 		 400 aa  338  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  46.72 
 
 		 401 aa  338  9e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  46.47 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.72 
 
 		 655 aa  335  1e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  47.7 
 
 		 399 aa  335  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  46.23 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  46.23 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  44.08 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  45.34 
 
 		 400 aa  332  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  45.26 
 
 		 402 aa  332  7.000000000000001e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07140  phosphoglycerate kinase  47.68 
 
 		 398 aa  332  7.000000000000001e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.954732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  46.45 
 
 		 400 aa  332  7.000000000000001e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  45.61 
 
 		 394 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  45.12 
 
 		 394 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  47.46 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  45.99 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  45.01 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  44.99 
 
 		 393 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  47.43 
 
 		 397 aa  329  6e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  46.08 
 
 		 435 aa  328  7e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  46.1 
 
 		 396 aa  328  9e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  46.1 
 
 		 396 aa  328  9e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  45.12 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  46.47 
 
 		 394 aa  328  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  47.19 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4529  Phosphoglycerate kinase  46.68 
 
 		 388 aa  327  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0899746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  46.33 
 
 		 396 aa  327  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  43.66 
 
 		 393 aa  327  3e-88  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  45.06 
 
 		 402 aa  326  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  43.8 
 
 		 397 aa  325  6e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  47.1 
 
 		 392 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  44.84 
 
 		 396 aa  323  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  45.59 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  44.82 
 
 		 402 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  43.55 
 
 		 401 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0515  phosphoglycerate kinase  45.12 
 
 		 399 aa  323  4e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  45.5 
 
 		 398 aa  322  6e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  46.84 
 
 		 395 aa  322  8e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  45.09 
 
 		 396 aa  322  9.000000000000001e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  44.04 
 
 		 398 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  46.84 
 
 		 395 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0677  phosphoglycerate kinase  47.74 
 
 		 396 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0616  phosphoglycerate kinase  44.12 
 
 		 399 aa  321  9.999999999999999e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.160418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>