More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0432 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
401 aa  786    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  91.77 
 
 
401 aa  727    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  71.32 
 
 
399 aa  550  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  70.07 
 
 
399 aa  547  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2170  Phosphoglycerate kinase  69.33 
 
 
399 aa  526  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  63.5 
 
 
398 aa  506  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2199  Phosphoglycerate kinase  65.09 
 
 
395 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000332645  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1942  Phosphoglycerate kinase  67.33 
 
 
395 aa  503  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.797468  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15210  phosphoglycerate kinase  63.84 
 
 
400 aa  493  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00329101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  63.59 
 
 
397 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2531  phosphoglycerate kinase  63.84 
 
 
399 aa  481  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  62.59 
 
 
395 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5198  Phosphoglycerate kinase  62.53 
 
 
388 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1549  Phosphoglycerate kinase  67.08 
 
 
405 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2980  Phosphoglycerate kinase  61.04 
 
 
399 aa  475  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.0361725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  62.84 
 
 
395 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3009  Phosphoglycerate kinase  62.84 
 
 
394 aa  475  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0329661 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11360  phosphoglycerate kinase  60.39 
 
 
415 aa  474  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.430751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  62.34 
 
 
395 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2539  Phosphoglycerate kinase  61.35 
 
 
412 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3709  phosphoglycerate kinase  59.75 
 
 
402 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2704  phosphoglycerate kinase  59.85 
 
 
407 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  56.76 
 
 
687 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2445  phosphoglycerate kinase  58.78 
 
 
407 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.637803  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2364  Phosphoglycerate kinase  60.89 
 
 
403 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15880  phosphoglycerate kinase  59.51 
 
 
402 aa  434  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00341206  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2405  phosphoglycerate kinase  58.78 
 
 
407 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2451  phosphoglycerate kinase  58.78 
 
 
407 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  57.67 
 
 
397 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2930  Phosphoglycerate kinase  59.23 
 
 
412 aa  424  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  56.75 
 
 
393 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  54.64 
 
 
394 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  54.89 
 
 
394 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  55.14 
 
 
394 aa  421  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  54.64 
 
 
394 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  54.39 
 
 
394 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  54.64 
 
 
394 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  54.64 
 
 
394 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  54.64 
 
 
394 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1829  phosphoglycerate kinase  55.25 
 
 
408 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  54.64 
 
 
394 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2801  Phosphoglycerate kinase  56.9 
 
 
398 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000278767  hitchhiker  0.000011346 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  56.31 
 
 
399 aa  420  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  54.64 
 
 
394 aa  420  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  55.81 
 
 
399 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  54.5 
 
 
646 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  54.64 
 
 
394 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11465  phosphoglycerate kinase  56.44 
 
 
412 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0038039  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  51.99 
 
 
397 aa  414  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  55.75 
 
 
397 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  53.38 
 
 
394 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2088  phosphoglycerate kinase  56.5 
 
 
408 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.283542  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3324  phosphoglycerate kinase  56.3 
 
 
399 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  55.06 
 
 
402 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  54.75 
 
 
394 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  55.11 
 
 
650 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  52.24 
 
 
396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3097  phosphoglycerate kinase  55.56 
 
 
399 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767989  normal  0.141125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  53.52 
 
 
400 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  55.05 
 
 
401 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  53.52 
 
 
400 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  54.23 
 
 
397 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  52.78 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  51.62 
 
 
397 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  53.87 
 
 
393 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  55.39 
 
 
397 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  53.16 
 
 
402 aa  397  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  53.13 
 
 
393 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  52.62 
 
 
394 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  54.66 
 
 
401 aa  393  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  54.41 
 
 
401 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  53.87 
 
 
394 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  52.97 
 
 
401 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.53 
 
 
655 aa  392  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  50.61 
 
 
397 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1638  phosphoglycerate kinase  55.61 
 
 
400 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  53.48 
 
 
397 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  53.06 
 
 
406 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  52.5 
 
 
396 aa  385  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  53.23 
 
 
397 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  52.13 
 
 
402 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  52.53 
 
 
402 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  52.12 
 
 
395 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  51.6 
 
 
401 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  54.55 
 
 
400 aa  381  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  51.6 
 
 
401 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  53.55 
 
 
398 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  53.23 
 
 
394 aa  382  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  51.85 
 
 
398 aa  380  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  52 
 
 
402 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  52 
 
 
402 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  51.75 
 
 
399 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  51.5 
 
 
402 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  53.02 
 
 
393 aa  378  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  50.98 
 
 
402 aa  378  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  50.12 
 
 
397 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  53.88 
 
 
400 aa  375  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  51.36 
 
 
400 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  52.54 
 
 
394 aa  373  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0616  phosphoglycerate kinase  49 
 
 
399 aa  372  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.160418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>