More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0138 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  83.38 
 
 		 646 aa  684    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 397 aa  798    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  72.32 
 
 		 650 aa  591  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  70.92 
 
 		 393 aa  554  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  64.99 
 
 		 397 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  64.74 
 
 		 397 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  62.37 
 
 		 396 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  63.04 
 
 		 394 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  62.78 
 
 		 394 aa  501  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  63.29 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  63.29 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  63.29 
 
 		 394 aa  504  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  63.29 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  63.54 
 
 		 394 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  62.78 
 
 		 394 aa  501  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  62.78 
 
 		 394 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  62.44 
 
 		 393 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  63.04 
 
 		 394 aa  500  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  60.91 
 
 		 393 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  60.91 
 
 		 395 aa  496  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  62.28 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  61.21 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  61.42 
 
 		 393 aa  491  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  60.81 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  59.75 
 
 		 402 aa  490  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  61.77 
 
 		 394 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  61.01 
 
 		 394 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  59.55 
 
 		 400 aa  484  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  60.55 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  61.06 
 
 		 396 aa  481  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  59.95 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  59.49 
 
 		 395 aa  480  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  60.15 
 
 		 396 aa  475  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  60.5 
 
 		 399 aa  477  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  60.8 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  59.3 
 
 		 400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  59.3 
 
 		 400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  57.79 
 
 		 399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  59.18 
 
 		 394 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  57.97 
 
 		 395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  59.3 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  57.79 
 
 		 399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  58.04 
 
 		 401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  59.19 
 
 		 397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  57.79 
 
 		 655 aa  464  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  59.06 
 
 		 403 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  58.12 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  59.75 
 
 		 397 aa  461  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  56.54 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  59.39 
 
 		 394 aa  461  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  58.69 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  60.05 
 
 		 398 aa  457  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  55.5 
 
 		 401 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  55.95 
 
 		 395 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  57.28 
 
 		 406 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  56.52 
 
 		 396 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  57.03 
 
 		 396 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  55.03 
 
 		 402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  56.52 
 
 		 396 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  54.8 
 
 		 396 aa  451  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  56.78 
 
 		 402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  56.85 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  54.82 
 
 		 392 aa  450  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  54.36 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  52.94 
 
 		 443 aa  450  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  54.61 
 
 		 402 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  57.76 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  55 
 
 		 401 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  54.52 
 
 		 401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  55.03 
 
 		 400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2229  phosphoglycerate kinase  57.14 
 
 		 395 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  54.75 
 
 		 401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  54.11 
 
 		 402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  55.03 
 
 		 401 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  54.96 
 
 		 435 aa  442  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  53.96 
 
 		 399 aa  442  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  57.29 
 
 		 400 aa  444  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2515  phosphoglycerate kinase  59.7 
 
 		 397 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2700  phosphoglycerate kinase  55.87 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  55.47 
 
 		 395 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2123  phosphoglycerate kinase  58.48 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  53.55 
 
 		 392 aa  435  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  56.64 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  55.75 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  50.76 
 
 		 393 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  53.13 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  56.42 
 
 		 399 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1398  Phosphoglycerate kinase  54.62 
 
 		 398 aa  431  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  55.08 
 
 		 398 aa  433  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  54.55 
 
 		 399 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  52.81 
 
 		 393 aa  431  1e-119  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  54.29 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  56.54 
 
 		 407 aa  428  1e-119  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  51.02 
 
 		 395 aa  427  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0416  phosphoglycerate kinase  53.18 
 
 		 400 aa  426  1e-118  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  54.55 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  54.06 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  56.13 
 
 		 403 aa  426  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0515  phosphoglycerate kinase  51.54 
 
 		 399 aa  424  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18653  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  55.75 
 
 		 401 aa  422  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>