More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1097 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1152  phosphoglycerate kinase  95.47 
 
 		 397 aa  708    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1097  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 397 aa  784    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4044  phosphoglycerate kinase  95.21 
 
 		 397 aa  706    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  74.81 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1918  phosphoglycerate kinase  76.9 
 
 		 398 aa  542  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.253475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2155  phosphoglycerate kinase  73.67 
 
 		 393 aa  523  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  65.06 
 
 		 400 aa  516  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3241  phosphoglycerate kinase  66.08 
 
 		 400 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2653  phosphoglycerate kinase  65.4 
 
 		 399 aa  505  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1694  phosphoglycerate kinase  68.69 
 
 		 396 aa  501  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  66.33 
 
 		 400 aa  501  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  66.08 
 
 		 396 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  65.32 
 
 		 400 aa  498  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  65.32 
 
 		 400 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  63.89 
 
 		 398 aa  498  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  63.66 
 
 		 401 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3538  phosphoglycerate kinase  64.3 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  62.85 
 
 		 398 aa  482  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  62.34 
 
 		 395 aa  484  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  61.58 
 
 		 395 aa  480  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0520  phosphoglycerate kinase  60.51 
 
 		 407 aa  475  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  62.34 
 
 		 398 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0221  phosphoglycerate kinase  62.09 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  62.37 
 
 		 398 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  61.62 
 
 		 398 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  61.01 
 
 		 396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2604  phosphoglycerate kinase  64.39 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0158  phosphoglycerate kinase  64.3 
 
 		 400 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2106  phosphoglycerate kinase  62.56 
 
 		 402 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.811046  normal  0.0646104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  60.51 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  62.28 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1318  phosphoglycerate kinase  62.18 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.575519  normal  0.28013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  61.38 
 
 		 398 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  59.75 
 
 		 398 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1965  phosphoglycerate kinase  61.56 
 
 		 395 aa  450  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.159546  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  56.23 
 
 		 409 aa  448  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  57.51 
 
 		 407 aa  444  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0766  phosphoglycerate kinase  59.7 
 
 		 396 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2596  phosphoglycerate kinase  59.18 
 
 		 403 aa  431  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1222  phosphoglycerate kinase  61.07 
 
 		 397 aa  428  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0140  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 400 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0449  phosphoglycerate kinase  53.03 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0576652  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  48.24 
 
 		 399 aa  385  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  51.02 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  51.26 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  52.53 
 
 		 393 aa  378  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  50.5 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  50.89 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  48.99 
 
 		 393 aa  368  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  49.25 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  47.74 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  50.76 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  49.38 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  50.76 
 
 		 401 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 		 394 aa  364  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  48.24 
 
 		 402 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  48.23 
 
 		 394 aa  363  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  48.23 
 
 		 394 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  48.23 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  48.49 
 
 		 402 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  48.23 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  48.23 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  47.47 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  48.23 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  51.02 
 
 		 401 aa  360  3e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  49.12 
 
 		 395 aa  359  5e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  47.99 
 
 		 402 aa  359  6e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1324  phosphoglycerate kinase  49.24 
 
 		 396 aa  358  8e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0186876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 396 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  48.97 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  48.97 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  48.6 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.22 
 
 		 650 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 		 394 aa  355  8.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  46.7 
 
 		 394 aa  354  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  48.22 
 
 		 401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 		 402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  47.3 
 
 		 402 aa  352  5.9999999999999994e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 		 406 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  45.61 
 
 		 398 aa  352  7e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  47.21 
 
 		 395 aa  351  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2229  phosphoglycerate kinase  47.72 
 
 		 395 aa  351  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.33 
 
 		 655 aa  350  3e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  49.5 
 
 		 402 aa  350  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  47.46 
 
 		 397 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  46.8 
 
 		 396 aa  349  4e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  48.73 
 
 		 389 aa  349  5e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>