More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3651 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3241  phosphoglycerate kinase  81.61 
 
 		 400 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 400 aa  801    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3538  phosphoglycerate kinase  81.86 
 
 		 400 aa  627  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2653  phosphoglycerate kinase  80 
 
 		 399 aa  618  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  74.62 
 
 		 398 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  71.46 
 
 		 400 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  71.46 
 
 		 400 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  68.61 
 
 		 395 aa  559  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  68.86 
 
 		 395 aa  559  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  70.45 
 
 		 400 aa  557  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  69.33 
 
 		 401 aa  557  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  70.56 
 
 		 398 aa  545  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  69.44 
 
 		 396 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  70.05 
 
 		 398 aa  541  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  69.29 
 
 		 398 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  69.04 
 
 		 398 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  67.42 
 
 		 398 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  68.18 
 
 		 398 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0158  phosphoglycerate kinase  69.95 
 
 		 400 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  69.21 
 
 		 398 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  69.27 
 
 		 398 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  67.18 
 
 		 396 aa  519  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  64.32 
 
 		 396 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2106  phosphoglycerate kinase  64.09 
 
 		 402 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.811046  normal  0.0646104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2604  phosphoglycerate kinase  65.99 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0520  phosphoglycerate kinase  61.68 
 
 		 407 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1152  phosphoglycerate kinase  65.82 
 
 		 397 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1097  phosphoglycerate kinase  65.06 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4044  phosphoglycerate kinase  65.57 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1318  phosphoglycerate kinase  63.64 
 
 		 398 aa  480  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.575519  normal  0.28013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  59.03 
 
 		 407 aa  471  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0766  phosphoglycerate kinase  62.37 
 
 		 396 aa  471  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  59.29 
 
 		 409 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1965  phosphoglycerate kinase  61.77 
 
 		 395 aa  467  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.159546  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0140  phosphoglycerate kinase  56.46 
 
 		 400 aa  460  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0221  phosphoglycerate kinase  60.2 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1918  phosphoglycerate kinase  63.57 
 
 		 398 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.253475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2155  phosphoglycerate kinase  63.1 
 
 		 393 aa  450  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1222  phosphoglycerate kinase  61.36 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1694  phosphoglycerate kinase  62.85 
 
 		 396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2596  phosphoglycerate kinase  59.27 
 
 		 403 aa  444  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0449  phosphoglycerate kinase  53.03 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0576652  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  51.79 
 
 		 392 aa  381  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  48.37 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  49.5 
 
 		 395 aa  366  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  49.23 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  49.11 
 
 		 400 aa  362  6e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 		 393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  47.84 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  49.23 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  48.45 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  48.45 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  46.97 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  48.46 
 
 		 395 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  47.61 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.62 
 
 		 650 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  47.33 
 
 		 394 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  47.07 
 
 		 394 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  47.58 
 
 		 394 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  47.33 
 
 		 394 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  48.99 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  47.07 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  48.88 
 
 		 403 aa  356  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  47.07 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  47.07 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  46.82 
 
 		 394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  46.82 
 
 		 394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  46.94 
 
 		 402 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  47.75 
 
 		 401 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  46.82 
 
 		 394 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  46.82 
 
 		 394 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  47.19 
 
 		 393 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  48.11 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  47.24 
 
 		 398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.35 
 
 		 646 aa  352  8e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  46.98 
 
 		 402 aa  352  8e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  48.99 
 
 		 402 aa  352  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  45.11 
 
 		 443 aa  351  1e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  47.61 
 
 		 395 aa  348  7e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1167  phosphoglycerate kinase  44.07 
 
 		 398 aa  348  1e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  48.32 
 
 		 401 aa  347  2e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  48.32 
 
 		 401 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  45.32 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  45.32 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  46.04 
 
 		 402 aa  346  5e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  46.29 
 
 		 402 aa  345  1e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  46.43 
 
 		 397 aa  344  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  48.45 
 
 		 400 aa  343  4e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  47.63 
 
 		 406 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  45.78 
 
 		 402 aa  342  5e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  46.25 
 
 		 398 aa  342  5.999999999999999e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  45.18 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  45.82 
 
 		 397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  49.11 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  47.68 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0677  phosphoglycerate kinase  47.25 
 
 		 396 aa  339  5e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  47.29 
 
 		 401 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  49.11 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>