More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1084 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 396 aa  791    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4044  phosphoglycerate kinase  75.95 
 
 		 397 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1152  phosphoglycerate kinase  75.95 
 
 		 397 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1097  phosphoglycerate kinase  75 
 
 		 397 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2155  phosphoglycerate kinase  71.14 
 
 		 393 aa  525  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  67.18 
 
 		 400 aa  519  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  66.75 
 
 		 400 aa  511  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  66.75 
 
 		 400 aa  511  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1694  phosphoglycerate kinase  69.37 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1918  phosphoglycerate kinase  72.26 
 
 		 398 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.253475 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  65.57 
 
 		 398 aa  506  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3241  phosphoglycerate kinase  66.24 
 
 		 400 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  65.48 
 
 		 400 aa  502  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2653  phosphoglycerate kinase  65.4 
 
 		 399 aa  494  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  62.5 
 
 		 401 aa  488  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  62.09 
 
 		 395 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  61.32 
 
 		 395 aa  484  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3538  phosphoglycerate kinase  65.23 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0520  phosphoglycerate kinase  61.93 
 
 		 407 aa  487  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0158  phosphoglycerate kinase  65.99 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0221  phosphoglycerate kinase  63.1 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  61.58 
 
 		 396 aa  482  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  61.68 
 
 		 398 aa  475  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  61.27 
 
 		 398 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  60.81 
 
 		 398 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1965  phosphoglycerate kinase  62.72 
 
 		 395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.159546  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  60.56 
 
 		 398 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  60.56 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2604  phosphoglycerate kinase  63.13 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  60.05 
 
 		 398 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  60.31 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2106  phosphoglycerate kinase  59.7 
 
 		 402 aa  455  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.811046  normal  0.0646104 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1318  phosphoglycerate kinase  61.42 
 
 		 398 aa  456  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.575519  normal  0.28013 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1222  phosphoglycerate kinase  63.52 
 
 		 397 aa  455  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  60.81 
 
 		 398 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0766  phosphoglycerate kinase  60.35 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  61.38 
 
 		 398 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  55.98 
 
 		 409 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0140  phosphoglycerate kinase  54.31 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  55.98 
 
 		 407 aa  435  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0449  phosphoglycerate kinase  54.55 
 
 		 400 aa  421  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0576652  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2596  phosphoglycerate kinase  57.29 
 
 		 403 aa  422  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  51.01 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  50.76 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  51.14 
 
 		 394 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  48.87 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  48.87 
 
 		 402 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  50.9 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 		 394 aa  378  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  48.87 
 
 		 402 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  48.1 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 401 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.34 
 
 		 650 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  48.36 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  52.02 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  48.86 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  48.86 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  48.47 
 
 		 394 aa  371  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  49.22 
 
 		 400 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  48.35 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  48.61 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  48.61 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  48.35 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  49.22 
 
 		 400 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  48.35 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  48.61 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  48.35 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  48.35 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  47.84 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  47.1 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  49.23 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 		 402 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  47.21 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  46.85 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  48.36 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  49.1 
 
 		 401 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  49.1 
 
 		 401 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  47.57 
 
 		 399 aa  359  4e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  46.35 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 		 396 aa  359  6e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  47.31 
 
 		 399 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.55 
 
 		 655 aa  357  2.9999999999999997e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  47.8 
 
 		 402 aa  355  6.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  48.34 
 
 		 398 aa  354  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1324  phosphoglycerate kinase  47.34 
 
 		 396 aa  353  2e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0186876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  46.08 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.33 
 
 		 646 aa  352  8e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  44.67 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  44.86 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  48.51 
 
 		 406 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  44 
 
 		 398 aa  349  5e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  49.23 
 
 		 400 aa  349  5e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0677  phosphoglycerate kinase  47.34 
 
 		 396 aa  349  6e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  48.84 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>